Ingénieur de recherche en analyse de données biologiques (h/f)

Informations générales

Intitulé de l'offre : ingénieur de recherche en analyse de données biologiques (H/F)
Référence : UMR9002-SOFKOS-052
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : MONTPELLIER
Date de publication : vendredi 7 mars 2025
Type de contrat : IT en contrat CDD
Durée du contrat : 13 mois
Date d'embauche prévue : 2 mai 2025
Quotité de travail : Complet
Rémunération : à partir de 2875 € bruts mensuels, ajustable selon experience
Niveau d'études souhaité : Doctorat
Expérience souhaitée : Indifférent
BAP : A - Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement
Emploi type : Ingénieur-e biologiste en analyse de données

Missions

Mise au point d’outils pour la visualisation graphique et l’interprétation de l’analyse des répertoires exprimés des Immunoglobulines (IG) et des récepteurs T (TR), récepteurs d’antigènes des cellules B et T respectivement.
Les répertoires analysés à visualiser seront issus des résultats d’IMGT/HighV-QUEST, le logiciel d’IMGT (the international ImMunoGeneTics information system, /), dédié à l’analyse haut-débit des séquences réarrangées IG et TR de l’homme et autres espèces de vertébrés.

Activités

-Développement d’outils de visualisation des données des répertoires exprimés des IG et TR de cellules B et T.
-Amélioration d’outils d’analyse des données tel que IMGT/StatMutations, dédié à la caractérisation des mutations somatiques dans les séquences IG.
-Intégrer ces outils avec des outils d’IMGT déjà existant tel que IMGT/HighV-QUEST
-Diffuser et valoriser les résultats.
-Travaille en équipe et interactions avec des biologistes et bio-informaticiens.

Compétences

-Compétences en programmation dans les langages JavaScript et R
-Connaissance en bash et python
-Connaissance souhaitable en shiny
-Compétence en visualisation des données
-Analyse de gros jeux de données
-Connaissances en immunogénétique serait un plus
-Bonne maîtrise de l'anglais
-Aptitude à travailler en équipe

Contexte de travail

/

Contraintes et risques

Travail sur ordianteur.