MISSIONS
Le projet vise à approfondir la compréhension des fonctions et de la régulation de LIX1 dans les tumeurs stromales gastrointestinales (GIST), en utilisant des approches de criblage protéomiques et génomiques, et à évaluer l'impact sur le métabolisme mitochondrial (McKey et al, BMC Biol 2016; Guérin et al, JCMM 2020; Guérin et al, Redox Biol 2022). Ce projet, financé par une subvention INCA PLBIO, sera mené en collaboration avec plusieurs partenaires scientifiques européens.
Contrat de 24 mois renouvelable. Une expérience en expérimentation animale ou en analyse single cell RNA seq serait appréciée. Le candidat devra inclure un CV, une lettre de motivation, sa liste de publications ainsi que le nom et l'adresse de 2 référents.
Activités
- Développer et conduire des approches en biochimie (immunoprécipitations, interactions protéine-protéine (TurboID, FRET), purifications de protéines recombinantes) pour identifier des protéines partenaires,
- Développer et évaluer le métabolisme mitochondrial (Oxygraphie Haute Résolution, SeaHorse, MitoSOX),
- Conduire des approches d'inhibition (ShRNA, CRISPR-Cas9) ou de criblage de molécules en culture cellulaire afin d'évaluer l'importance des protéines partenaires,
- Exploiter et présenter les résultats des analyses tout en garantissant le suivi et la qualité,
- Participer à la diffusion et valorisation des résultats sous forme de présentations orales et de publications.
Compétences
- Expertise en métabolisme mitochondrial,
- Analyse d'interactions protéine-protéine (coIP, TurboID, FRET),
- Maîtrise de l'immunofluorescence (cellules, tissus) et imagerie confocale,
- Compétences en culture cellulaire (lignées, primaires) et analyses fonctionnelles (prolifération, migration),
- Une expérience en expérimentation animale ou en analyse de séquençage unicellulaire (single-cell RNA-seq) serait un atout.
Contexte de travail
Le laboratoire de Physiologie et médecine expérimentale du coeur et des muscles (PhyMedExp) est une unité mixte de recherche (INSERM, CNRS, Université de Montpellier). Cette unité pluridisciplinaire s'intéresse à la physiologie et la physiopathologie des tissus contractiles (muscles cardiaques, lisses et striés) et à leurs interactions avec leur environnement. L'équipe d'accueil se concentre sur le développement du muscle lisse digestif et ses pathologies associées. Elle est composée de 7 chercheurs, 3 cliniciens, 5 ingénieurs et 5 doctorants (https://www.phymedexp.com/digestif-developpement-et-pathologies/).
Contraintes et risques
- Travail sur OGM et modèle animal.
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