L'équipe MAB du LIRMM (https://www.lirmm.fr/~swenson) recherche un chercheur postdoctoral maîtrisant les calculs et les statistiques, pour travailler pendant un an sur un projet lié à la réorganisation du génome chez les anophèles (moustiques). Le projet comprend le développement d'algorithmes pour l'inférence des réarrangements ancestraux à un clade dans une phylogénie, ainsi que leur mise en oeuvre. Le projet sera réalisé en étroite collaboration avec le laboratoire de Sharakhov à Virginia Tech.
Activités
Reconstruction des ordres des gènes dans les chromosomes à partir des annotations
- Implémentation d'outils informatiques pour lier les réarrangements génomique avec le donne Hi-C
- Développement de méthodes statistiques pour les réarrangements génomiques
Compétences
- Connaissances des algorithmes et structures de données
- Développement des nouvelles algorithmes et structures de données
- Connaissances et applications des méthodes statistiques
- Compétences en programmation
Contexte de travail
Le travail sera effectué au LIRMM, au sein de l'équipe MAB (méthodes et algorithmes pour la bioinformatique) sous la responsabilité de Krister Swenson (https://www.lirmm.fr/~swenson).
Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.
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