Mission :
La personne recrutée aura pour mission de produire des banques génomiques pour décrire la diversité génétique de populations de poissons marins. Cette mission s'effectuera dans le cadre du projet ANR DemoMar, qui vise à inférer la démographie récente d'espèces marines exploitées à partir de l'analyse des co-ascendances génomiques partagées entre individus d'une même espèce. La personne recrutée sera formée et accompagnée par du personnel permanent pour la mise en œuvre des techniques moléculaires qui seront utilisées dans le projet, notamment l'extraction d'ADN de haut poids moléculaire et la construction de librairies d'haplotagging. Elle travaillera en coordination avec les différents collaborateurs du projet impliqués dans la collecte des échantillons, le travail de biologie moléculaire et le séquençage sur les plateformes associées.
Activités :
- Assurer la bancarisation et la traçabilité des échantillons collectés dans le projet (environ 1600 individus répartis sur 4 espèces).
- Réaliser des extractions d'ADN de haut poids moléculaire sur des échantillons de tissus de poissons, exclure les fragments courts par sélection de taille, et caractériser les fragments obtenus (quantité, longueur, pureté) à l'aide d'instruments de mesure (Nanodrop, Qubit, FemtoPulse).
- Construire des banques génomiques en utilisant le protocole d'haplotagging, basé sur l'utilisation de la transposase Tn5 et d'un marquage des fragments d'ADN grâce à des barcodes moléculaires. Caractériser les banques par électrophorèse sur Fragment Analyzer et dosage qPCR.
- Passer des commandes de consommables et communiquer avec les plateformes en charge du séquençage des banques.
Experience: Expérience exigée de 1 An(s)
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