Ingénieur d'études pour la conception d'un microscope à feuille de lumière (h/f)

Informations générales

Intitulé de l'offre : Ingénieur d'études pour la conception d'un microscope à feuille de lumière (H/F)
Référence : UMR5048-FLOLEP-108
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : MONTPELLIER
Date de publication : vendredi 14 février 2025
Type de contrat : IT en contrat CDD
Durée du contrat : 5 mois
Date d'embauche prévue : 1 mai 2025
Quotité de travail : Complet
Rémunération : Entre 2491 € et 2658 € bruts par mois selon expérience
Niveau d'études souhaité : BAC+3/4
Expérience souhaitée : 1 à 4 années
BAP : C - Sciences de l'Ingénieur et instrumentation scientifique
Emploi type : Ingénieur-e en conception instrumentale

Missions

Mise au point d’un microscope à feuille de lumière pour l’imagerie en profondeur du cerveau de Drosophila melanogaster.

Activités

Le projet consiste dans le développement d’un microscope de feuille de lumière pour réaliser des expériences d’imagerie séquentielle dans les cerveaux de la Drosophile.

En préparation de ce projet, le travail du candidat ou de la candidate se concentrera selon trois axes :
(1) faire les dessins optiques du microscope et les simulations afin d’optimiser le système;
(2) réaliser les achats d’instrumentation;
(3) réaliser des tests sur des échantillons biologiques afin d’optimiser le dessin de construction du microscope.

Compétences

Le candidat ou la candidate aura une expertise en ingénierie optique. Il ou elle manifestera un fort intérêt à travailler à l'interface entre la physique, la bio-informatique et la biologie.

Contexte de travail

Détecter simultanément plusieurs espèces moléculaires, telles que l'ADN, l'ARN et les protéines, dans les tissus et les organismes est essentiel pour comprendre les processus biologiques complexes, notamment la signalisation cellulaire, l'expression génique et l'organisation des tissus. Les récents progrès des techniques d'imagerie multiplexés et super-résolues permettent d’étudier les interactions spatiales et moléculaires avec une résolution sans précédent, apportant des informations cruciales sur des processus tels que le développement du cancer et l'embryogenèse.

Dans notre groupe, nous avons en particulier développé la technique d’imagerie
Hi-M pour étudier l’organisation tri-dimensionnelle de la chromatine dans des cellules individuelles. L’ensemble des détails techniques et protocoles d'analyse ont été publiés en open source, rendant ainsi la technologie largement accessible à la communauté scientifique.

Une application potentielle majeure de ces techniques réside dans l'étude des cancers pédiatriques, qui s’initient souvent au cours du développement foetal à la suite de perturbations dans les mécanismes de régulation génique. Le cerveau de la Drosophile s’avère être un modèle particulièrement utile pour comprendre les mécanismes impliqués dans ces maladies rares. Cependant, les technologies d'imagerie actuelles présentent une limitation majeure : l’impossibilité de les utiliser pour l’imagerie de tissus ou d’organismes entiers en 3D, ce qui complique l'étude des systèmes biologiques complexes.

Contraintes et risques

Le projet adoptera une approche de science ouverte, garantissant que tous les développements seront partagés librement, sans dépôt de brevets, permettant ainsi une adoption et une réutilisation rapide par les chercheurs au sein du consortium Cell-ID, et par la communauté scientifique en général. La construction du microscope et les expériences se feront au laboratoire sur des lignes de Drosophile existantes, et nous n’aurons pas besoin d’avoir accès à des infrastructures nationales telles que des centres de calculs (Genci) ni aux grands instruments, ni aux salles de cultures (. P2, P3).

Ce projet permettra d'étudier la structure 3D de la chromatine et la dynamique de la transcription au cours de la différenciation neuronale chez la Drosophile. Ces avancées faciliteront non seulement l'étude des modèles de cancer dans cet organisme modèle, mais ouvriront également la voie à son application dans d’autres modèles de cancers pédiatriques dans le cadre du projet CellID.