Ingénieur / ingénieure de recherche scientifique (h/f)

Mission :
La personne travaillera selon une approche interdisciplinaire, génétique et d'ethnoécologique au sein du projet RESILIANCE (Résilience des châtaigneraies fruitières et innovation de techniques culturales face aux changements globaux). C'est un projet participatif financé par le MASA (Ministère de l'Agriculture et de la Sécurité Alimentaire) dans le cadre de son programme PARSADA. Ce projet porté par le CNRS travaille en complémentarité avec 5 autres projets de la filière châtaigne dans le cadre du Plan National d'Actions Châtaigne animé par le Syndicat National des Producteurs de Châtaignes. L'ensemble de ces projets intègre de nombreux acteurs des territoires castanéicoles français aux échelles régionale et nationale. La personne contribuera à l'objectif premier du projet RESILIANCE qui est d'apporter à la filière castanéicole des éléments pour envisager une châtaigneraie robuste, notamment dans le cadre du changement climatique. La personne recrutée contribuera à l'action 2 de ce projet, décrite ci-dessous.
Action 2, Caractérisation des variétés par le génotypage, le phénotypage et le recueil des savoirs locaux.
Cette action portera sur la caractérisation de la résilience d'une gamme variétale étendue ainsi que de châtaigniers poussant spontanément, en se focalisant sur la région méditerranéenne. Menée au sein des fermes et dans leurs alentours, ces études interrogerons également les savoirs locaux des producteurs sur différents traits des arbres, dont notamment certains stades phénologiques, le comportement vis à vis de la sècheresse et des hautes températures, les caractéristiques de la floraison et de la fructification. Notre hypothèse est que cette région est susceptible d'abriter des variétés ou des porte-greffes ayant déjà été sélectionnés pour leur résilience aux températures élevées et aux sécheresses. Nous espérons ainsi identifier une gamme de ressources génétiques directement utilisables par la profession castanéicole dans le contexte des changements en cours. L'Ingénieur d'études contribuera à des fiches variétales produites dans le cadre de RESILIANCE et à la projection des variétés et francs pieds identifiés dans des bases cartographiques topoclimatiques générées par ailleurs par ce projet. Ces cartes incluront la position des fermes actuellement en production, ceci après accord préalable des producteurs concernés. La personne, à tous les niveaux de ses travaux devra gérer les dimensions éthiques relatives au RGPD et au Protocole de Nagoya. Il contribuera aussi à développer avec les autres membres de l'équipe de RESILIANCE un Outil d'Aide à la Décision (OAD) qui sera testé avec les producteurs à travers des séries d'ateliers participatifs à l'échelle régionale.
La personne recrutée aura pour mission de mener des recherches sur le terrain dans des fermes, en étroite relation avec les producteurs, mais aura aussi une activité majeure de génotypage et de phénotypage du matériel récolté. Les activités de génotypage supposeront de récolter les échantillons sur le terrain (feuilles), de procéder à l'extraction de l'ADN et de mener tout le processus de génotypage en utilisant les deux plateformes ( GEMEX au CEFE et GenSeq à l'ISEM).
Le phénotypage de la biologie florale et des fruits sélectionnés ou non par les humains, supposera un ou deux autres passages sur le terrain à la saison de la floraison et de la fructification sur les mêmes fermes visitées précédemment, mais aussi des mesures en laboratoire.
Les sites d'étude seront l'Ardèche, Les Cévennes (Lozère, Gard et Haut Languedoc) et possiblement le Var et la Corse. Pour les régions éloignées, la personne collaborera en 2026 avec 2 Master en soutien à ces travaux notamment pour la partie génotypage en Corse, en collaboration étroite avec l'INRAE San Giuliano en Corse. En 2027, la personne encadrera un Master afin de faciliter la projection des variétés et des arbres issus de semis sur des cartes topoclimatiques produites dans le cadre de RESILIANCE.

Activités :
La personne recrutée sera chargée de :
Mener des recherches en ethnoécologie sur une quarantaine de fermes dans les zones d'études précisées plus haut, non inclus les fermes situées dans le Var et en Corse où les recherches seront menées par des étudiants en Master ou d'autres membres de l'équipe RESILIANCE.
Développer l'échantillonnage des variétés et arbres issus de semis de ces fermes avec l'aide d'une part, des organismes régionaux en Ardèche et en Cévennes afin de cibler les fermes les plus appropriés pour les travaux en ethnoécologie..
Travailler étroitement avec l'équipe d'encadrement du projet RESILIANCE tout autant sur les savoirs locaux que sur les aspects de génétique et de phénotypage.
Collaborer avec les organismes régionaux en Ardè

Experience: Débutant accepté