Vous intégrerez l'unité mixte de recherche (UMR) INRAE-CIRAD-IRD-Montpellier Institut Agro-Université Montpellier « Plant Health Institute of Montpellier » (PHIM). Dans cette unité nous étudions les interactions plante / environnement impactant l'état sanitaire des plantes, leur croissance et leur productivité. Les interactions plantes - microbes ou insectes (pathogènes ou bénéfiques) sont étudiées par des approches de biologie et génétique moléculaires, de génétique et génomique des populations, d'épidémiologie, de dynamique et de modélisation des populations, à différentes échelles. L'unité compte 136 agents permanents et 60 non permanents répartis dans 4 pôles de recherche.
Vous serez affecté-e à l'équipe CIME (Cereal Immunity and Magnaporthe Effectors) du pôle ITEM (InTeractions plante pathogène : Evolution et Mécanismes). Ce pôle compte 5 équipes (46 agents permanents dont 5 dans l'équipe CIME). Les recherches d'ITEM visent à élucider les mécanismes moléculaires et les processus évolutifs façonnant les interactions entre plantes et agents pathogènes ou symbiotiques, fongiques et bactériens. L'étude des génomes et des gènes impliqués dans les interactions (notamment les relations structure/fonction/évolution) est au coeur des recherches d'ITEM et en constitue le socle fédérateur. L'équipe CIME étudie les mécanismes moléculaires qui conduisent aux maladies fongiques ou qui, au contraire, permettent aux plantes de résister naturellement à ces maladies, dans le but de mieux comprendre le dialogue moléculaire entre plantes et microorganismes pathogènes et de générer des connaissances pour une protection efficace et durable des cultures.
Votre mission sera de mener, de manière transversale et en interaction avec les chercheurs de PHIM, l'analyse fonctionnelle de gènes et de protéines clés du dialogue moléculaire entre les plantes et les agents pathogènes fongiques, bactériens ou autres.
Pour cela, vous utiliserez une large gamme d'outils et techniques de biochimie des protéines, de biologie moléculaire et de génomique fonctionnelle afin d'étudier des récepteurs immunitaires, des effecteurs de virulence et leurs cibles chez la plante. Vous vous servirez des méthodes de clonage à haut débit et d'outils de biologie synthétique pour créer des constructions géniques nécessaires à vos analyses.
A 20% de votre temps, vous formerez et encadrerez d'autres agents dans l'utilisation de ces techniques, et vous gérerez et centraliserez, au niveau de l'unité, les outils et ressources biologiques pour la biologie synthétique, les clonages à haut débit et la biochimie des protéines.
Vos activités comporteront l'analyse de la fonction de gènes et de l'activité de protéines par un large spectre de techniques et d'approches :
- Production de protéines recombinantes chez E. coli ou dans des systèmes eucaryotes (ex. plantes ou cellules d'insectes) ;
- Purification de protéines, par diverses techniques (ex. affinité, exclusion de taille, etc.) ;
- Carac
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