🌐 L'INSERM recrute un.e Ingénieur.e d'études en biologie structurale computationnelle / bio-informatique en CDD, à temps plein, à partir du 01 juin 2025.
🚀 Votre défi ?
La personne recrutée rejoindra une équipe multidisciplinaire dans le cadre d’un projet collaboratif innovant visant la conception computationnelle d’enzymes de modification de l’ARN. Ce projet s’inscrit dans l’axe de recherche du Dr. Cédric Leyrat, spécialiste en biologie structurale computationnelle et expérimentale. La personne recrutée aura pour principale mission de concevoir et optimiser des pipelines de calcul et jouera un rôle clé dans la réussite du projet de recherche en collaborant avec des chercheurs postdoctoraux ainsi que des partenaires externes spécialisés en bio-informatique et biologie expérimentale.
🔎 Vos responsabilités ?
* Concevoir, développer et maintenir des pipelines de calcul pour la modélisation et l’ingénierie des enzymes de modification de l’ARN ;
* Mettre en œuvre des algorithmes de prédiction de structure protéique et de conception de protéines adaptées aux besoins du projet ;
* Exploiter des environnements UNIX afin d’assurer une exécution efficace des workflows de calcul en utilisant des serveurs HPC ;
* Optimiser les ressources de calcul et améliorer les performances des flux de travail ;
* Rédiger, optimiser et maintenir des scripts en Python et Bash pour l’automatisation des analyses et le traitement des données ;
* Développer des solutions pour automatiser la collecte et l’analyse des données expérimentales et computationnelles ;
* Se tenir au courant des nouveaux outils et algorithmes en biologie structurale computationnelle, tels que AlphaFold, Rosetta, ProteinMPNN, et RFdiffusion ;
* Intégrer ces outils dans les processus de conception et d’optimisation des enzymes ;
* Collaborer activement avec un chercheur postdoctoral, ainsi que des chercheurs et techniciens expérimentaux afin de valider les résultats des prédictions informatiques ;
* Participer à la mise en œuvre de validations expérimentales basées sur les modèles calculés et à l’interprétation des données biologiques ;
* Rédiger et documenter les workflows de calcul, les rapports de progrès et les publications scientifiques potentielles ;
* Contribuer à la rédaction d’articles et à la présentation des résultats lors de conférences ou dans des publications scientifiques.
🎯 Vos savoir-faire ?
* Capacité à concevoir, développer et maintenir des pipelines de calcul pour modéliser et optimiser des enzymes de modification de l’ARN ;
* Capacité à optimiser des ressources de calcul pour garantir l’efficacité des workflows en utilisant des plateformes HPC ;
* Capacité à mettre en œuvre des algorithmes de prédiction de structure protéique pour concevoir des protéines adaptées aux objectifs du projet de recherche ;
* Capacité à intégrer et adapter ces outils pour améliorer la conception des enzymes de modification de l’ARN ;
* Capacité à travailler au sein d’une équipe multidisciplinaire en collaborant étroitement avec des chercheurs, bio-informaticiens et des biologistes expérimentaux ;
* Capacité à traduire les résultats des calculs computationnels en hypothèses biologiques testables et à participer activement à la validation expérimentale des prédictions ;
* Capacité à développer des solutions pour automatiser la collecte, l’analyse et l’intégration des données, y compris l’élaboration de scripts d’automatisation avec Python et Bash ;
* Capacité à rédiger des rapports techniques et scientifiques, y compris la documentation des workflows de calcul, les rapports de progrès et la contribution aux publications.
🎯Vos savoir-être ?
* Rigueur scientifique méthodique ;
* Esprit d’équipe ;
* Adaptabilité et curiosité scientifique ;
* Autonomie et proactivité.
💼 Vos conditions de travail ?
* Date de prise de poste : 01.06.2025
* Durée : 12 mois (renouvelable)
* Temps de travail : temps plein
* Nombre d'heures hebdomadaires : 38h30
* Télétravail : 1 à 2 jours par semaine
* Rémunération : A partir 2445.87 € brut mensuel ; variable en fonction de l'expérience.
* Eléments complémentaires de rémunération : Restauration collective, participation à la mutuelle, forfait mobilité durable, supplément familial de traitement, participation aux frais de transport, indemnité télétravail, CLAS-CAES.
🔬 Votre structure ?
L'Institut de génomique fonctionnelle (IGF) est une unité mixte de recherche composée de 330 personnes et 23 équipes travaillant dans les domaines des neurosciences, de la physiologie et du cancer et hébergeant 7 plateaux techniques (génomique, protéomique, criblage pharmacologique, vectorologie, imagerie du petit animal, exploration fonctionnelle). L'IGF est un institut de recherche multidisciplinaire doté d'installations de pointe, y compris l'accès à des serveurs HPC et à des plateformes avancées de biologie structurale, de génomique et de protéomique. La personne sélectionnée sera pleinement intégrée dans un environnement collaboratif et dynamique.
🚀 Prêt.e à relever ce défi passionnant ? Rejoignez-nous dès le 12 décembre 2024 pour une aventure professionnelle enrichissante !
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