Ingénieur de recherche développement logiciels (h/f)

À propos de nous

L'Université Claude Bernard Lyon 1 est une université pluridisciplinaire. Elle déploie son activité sur 13 sites. Elle compte près de 46 000 étudiants/étudiantes et emploie 4 900 personnels.

L'Université Lyon 1 propose, depuis plus de 50 ans, une formation d'excellence et une recherche de pointe. En tant qu'employeur responsable, l'Université Lyon 1 s'engage à favoriser la qualité de vie au travail, l'inclusion professionnelle et l'innovation individuelle et collective.


Mission

Missions principales:


La personne recrutée assurera le développement et la maintenance d’applications et de logiciels de recherche en apprentissage profond et en masse de données en imagerie médicale et biologique au sein du laboratoire CREATIS. Ces développements s’effectueront à la fois dans le cadre de projets structurants et fédérateurs internes ou d’envergure nationale ou internationale pour établir une plateforme IA mutualisée et accessible aux membres du laboratoire et ses collaborateurs. La mise à disposition via des modules interopérables et évolutifs pour la communauté sera un élément important du travail de l’ingénieur(e), en particulier au vu du caractère critique des données traitées et ainsi que de l’aspect extrêmement compétitif des domaines d’application.


L’ingénieur(e) recruté(e) s’inscrira dans une démarche qualité, en assurant et pilotant les activités d’intégration continue du laboratoire, afin d’accompagner la mise à disposition des développements à une large communauté
scientifique. L’ingénieur(e) sera force de proposition sur les technologies émergentes et mutualisables avec différentes collaborations. Par ailleurs, l’ingénieur(e) aura une activité de développement, d’accompagnement et
d’information autour des outils SI développés en interne.


Activités principales de l'agent:


- Assurer le développement de logiciels ou de plugins de recherche et de calcul scientifique

- Développer et maintenir en production une plateforme IA mutualisée, ouverte et fédératrice en intégrant les problématiques de sécurité liées aux données sensibles.


- Développer des interfaces avancées pour visualiser des données médicales 3D/4D et les données dérivées associées.


- Porter et maintenir des algorithmes en apprentissage profond en collaboration avec les chercheurs du laboratoire sur des problématiques novateurs et fédérateurs en imagerie médicale (segmentation de structures pathologiques, apprentissage fédéré, modèles de fondation...)


- Containériser des algorithmes pour des déploiements sur des clusters de calcul internes ou externes.


- Assurer l'intégration continue des logiciels à fort impacts du laboratoire.


- Mettre à disposition des applications ou librairies fédératrices ou émergentes en assurant un contrôle qualité renforcé.


- Maintenir et développer les outils SI du laboratoire en assurant un accompagnant auprès des différents utilisateurs.


Logiciels ou matériels spécifiques utilisés : Monai, bibliothèques d'apprentissage profond


Profil

Diplôme requis pour les contractuels : Diplôme > Bac + 5 (Doctorat, Ingénieur de grande école ou ENS)


Spécialité/domaine: Informatique/ Traitement d'images


Expérience professionnelle souhaitée dans le domaine : entre 1 et 3 ans


Compétences attendues :
Langages de programmation orientés objet, particulièrement Python, Java, C++
Librairies d’apprentissage profond: PyTorch, Tensorflow
Contenérisation : Docker, Dockerhub, Kubernetes, Openstack Framework : slicer3D, Monai, OHIF Connaissances en imagerie médicale
Capacité à proposer et réaliser des mises en œuvre de référence, des prototypes et démonstrateurs : autonomie, créativité, veille proactive, écoute des besoins.
Très bonne aptitude au travail en équipe, à distance.
Autonomie dans la conduite des travaux.


Connaissances:
Formats d’images en imagerie médicale (DICOM, Nifti), et systèmes d’imagerie (PACS)
Outils de versioning et de travail collaboratif (git) et de gestion de projets (gitlab)
Outils de déploiement, de testing et d'intégration continue
Algorithmies en traitement d’images


Savoir être:
Savoir s'intégrer dans des projets existants en étant force de proposition.
Sens de l'organisation et coordonner des développements en pilotant des ingénieurs.
Sens relationnel
Esprit de synthèse et de communication.
Vecteur des bonnes pratiques en génie logiciel et en expérimentation



Poste à pouvoir le 01/01/2025

Le poste est ouvert aux contractuels de catégorie A

Rémunération mensuelle brute: 2 935 €

En rejoignant l'Université Lyon 1, vous pourrez bénéficier de :

* 48.5 jours de congés annuels, dès la première année universitaire, aménagement possible du temps de travail sur 4.5 jours, 37h30 / semaine, la possibilité d'avoir des jours de télétravail réguliers et/ou ponctuels, sous conditions,

* la participation au remboursement des frais de transport, forfait mobilité durable, aux frais complémentaire santé à hauteur de 15€/mois, ...

* l'accès à des prestations d'action sociale, accès aux services de la crèche et du centre de loisirs situés sur le campus Lyon Tech La Doua

* l'accès aux activités artistiques et sportives de l’université, tarifs préférentiels loisirs,

* possibilités de développement professionnel en interne (concours, mobilité, formation continue et parcours professionnel)

* restauration sur le campus avec une participation financière de l’université