Ingénieur.e de recherche en logiciels et données d’imagerie

Fonction poste à pourvoir :

Ingénieur.e de recherche en logiciels et données d’imagerie

Poste à pourvoir

CDD 1 an

Présentation de l’IHU ICAN

L’institut Hospitalo-Universitaire pour l’Innovation en Cardiométabolisme et Nutrition (IHU ICAN) constitue un pôle d’excellence dans le domaine des maladies du cardiométabolisme : diabète, obésité, MASH, maladies du cœur et des vaisseaux. Créé en 2011, l’IHU-ICAN est une fondation de coopération scientifique qui a pour vocation de développer une médecine personnalisée pour améliorer la prévention, le diagnostic et la prise en charge des maladies du cardiométabolisme, en favorisant une recherche translationnelle et pluridisciplinaire. Ces pathologies chroniques représentent la 1ère cause de décès dans le monde.

L’IHU ICAN est l’un des 19 IHU labélisés en France et mène des projets de recherche portés par une communauté d’environ 400 chercheurs et médecins, appartenant à ses fondateurs : Sorbonne Université (SU), l’INSERM, et l'Assistance Publique Hôpitaux de Paris (AP-HP). L’IHU ICAN est situé dans l’hôpital de la Pitié Salpêtrière (Paris 13ème).

Dirigé par le Pr. Stéphane Hatem (PU-PH), de l’IHU ICAN est une fondation de coopération scientifique qui déploie des moyens d’aide à la recherche et à l’investigation, dont :

- Un pôle Plateformes et Business Développement, regroupant 6 plateformes de recherche translationnelle : IPS, cellules hépatiques, lipidomique, métabolomique, CRB et Data sciences (~20 salariés).

- Un pôle Recherche Clinique, comprenant un plateau d’investigation clinique ainsi qu’une IRM dédiée à la recherche cardiométabolique et associée à un Corelab expert.

L’IHU ICAN est engagé dans une démarche de certification ISO 9001.

Description du poste

Rattaché(e) à la responsable du plateau ICAN Imaging, le.a ingénieur.e de recherche en logiciels et données d’imagerie a pour mission d’organiser le circuit et les bases de données d’imagerie, de réaliser des développements logiciels pour les besoins d’ICAN Imaging de gérer le parc logiciel du Core Lab en interaction avec les éditeurs industriels ou académiques, ainsi que l’ingénieur de traitement avancé, et de concevoir des pipelines optimaux d’analyse allant de la donnée au biomarqueur, en concertation avec ses responsables fonctionnels et les éditeurs de logiciels. Il est amené à assurer, dans le cadre des missions qui lui sont confiées, le lien entre la plateforme ICAN Imaging, les chercheurs du Laboratoire d’Imagerie Biomédicale (LIB), les médecins et ingénieurs hospitaliers du service d’Imagerie cardiovasculaire et thoracique (ICT) ainsi que les éditeurs des logiciels industriels.

Missions :

1. Gestion du parc logiciel métier
2. Gérer le parc logiciel du Core Lab en interaction avec les éditeurs industriels ou académiques, ainsi que l’ingénieur d’études en imagerie avancée.
3. Concevoir des pipelines optimaux d’analyse allant de la donnée au biomarqueur avec la gestion des arborescences de sauvegarde en interaction avec les éditeurs de logiciels et les ingénieurs du Core Lab.
4. Déployer les logiciels jugés utiles pour les études du Core Lab afin de fluidifier l’accès aux données sources et résultats des traitements.
5. Assurer l’interfaçage des besoins de ICAN Imaging avec les logiciels académiques du LIB et les logiciels industriels.
6. Assurer une veille sur les solutions logicielles métier.
1. Développements informatiques pour optimiser la gestion de la donnée d’imagerie
2. Gérer et planifier les besoins en développements informatiques pour le Core Lab ICAN.
3. Réaliser les développements complémentaires pour optimiser, augmenter les fonctionnalités et maintenir le site de téléversement d’images UPLOAD.
4. Assurer l’interfaçage avec le LIB pour transiter les logiciels recherche mis au point, validés au LIB et déposés auprès de la SATT vers des logiciels adaptés à une utilisation Core Lab. Cette mission s’adaptera aux besoins des différentes études mutuellement gérées par ICAN Imaging et le LIB.
1. Gestion des bases de données d’imagerie
2. Cartographier les flux de données et des métadonnées d’imagerie existants et futurs, et participer à la définition des procédures et modes opératoires applicables pour la gestion des données d’ICAN Imaging.
3. Mettre en place et optimiser les pipelines en termes de traitement d’images pour structurer la gestion de la donnée liée à l’imagerie, en concertation avec l’ingénieur d’études en Imagerie Avancée.
1. Autres missions
2. Participer aux réunions de recherche du Core Lab / plateforme d’imagerie ICAN et aux réunions de recherche scientifiques avec les équipes ICT et LIB.
3. Interagir avec la task force recherche du DMU Diament pour déployer des outils de fouille/structuration de données d’imagerie communs.
4. Interagir avec les équipes montage de projet et le référent informatique pour aider à la planification des besoins en informatique pour l’imagerie.
5. Participer aux réunions du pôle recherche clinique, en lien avec les missions de ICAN Imaging.
6. Participer aux réunions et évènements organisés par l’IHU ICAN.
7. Participer à la démarche qualité conformément aux normes applicables.
8. Former les utilisateurs aux nouveaux logiciels et pipelines mis en place en concertation avec l’ingénieur en imagerie avancée pour un passage de relai.
9. Gérer les retours utilisateurs et d’éventuels bugs.
10. Encadrer les stagiaires développeurs.

Profil et compétences recherchés :

* Diplôme d’ingénieur / M2 de spécialité informatique.
* Formation (ou expérience) en développement informatique pour l’imagerie médicale.
* Expérience préalable significative dans le développement de solutions de traitement d’images médicales.
* Bonnes compétences en communication en français et en anglais et en travail en équipe.
* Connaissances approfondies des logiciels d’analyse d’images (MATLAB, etc.).
* Compétences en programmation (Python, C++).
* Environnement professionnel du domaine d’activité.

Type de contrat : CDD 1 an

Rémunération : à définir selon expérience

Contact : Khaoula Bouazizi, Responsable du plateau ICAN Imaging

Merci d’envoyer un CV et une lettre de motivation par email à k.bouazizi@ihuican.org

Le plateau d’investigation clinique étant situé au sein de l’hôpital de la Pitié Salpêtrière, le.la candidat.e sera soumis.e aux règles de travail en milieu hospitalier et notamment en termes d’obligation vaccinale et de respect de la charte de la laïcité dans les services publics.

Type d'emploi : Temps plein, CDD
Statut : Cadre
Durée du contrat : 12 mois

Avantages :

* Prise en charge du transport quotidien
* Restaurant d'entreprise
* RTT
* Travail à domicile occasionnel

Horaires :

* Du lundi au vendredi

Lieu du poste : En présentiel

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