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Ingénieur de recherche en analyse bio-informatique des éléments transposables et de leur ARNs régulateurs (piRNA) (H/F)
Date Limite Candidature : mercredi 2 octobre 2024 23:59:00 heure de Paris
Informations générales
Intitulé de l'offre : Ingénieur de recherche en analyse bio-informatique des éléments transposables et de leur ARNs régulateurs (piRNA) (H/F)
Date de publication : mercredi 11 septembre 2024
Type de contrat : CDD Technique/Administratif
Durée du contrat : 9 mois
Date d'embauche prévue : 1 janvier 2025
Quotité de travail : Temps complet
Emploi type : Ingénieur-e biologiste en analyse de données
Institut de Recherche sur la Biologie de l’Insecte (IRBI) UMR 7261 CNRS – Université de Tours
Présentation du poste : L’ingénieur exercera son activité au CNRS, à l'IRBI, dans le cadre du Projet INVATRANSPO (Projet ANR) sur le volet concernant la dysgénèse hybride entre deux sous-espèces de la guêpe parasitoïde Cotesia congregata. Le projet a pour objectif d’identifier et d’étudier l’impact d’un élément transposable dans la spéciation sympatrique en cours entre ces deux sous espèces spécialisées sur des hôtes différents.
Présentation de l’équipe : L’ingénieur travaillera au sein de l’équipe IMIP : Interactions Micro-organismes-Insectes-Plantes de l’IRBI et collaborera également avec les collègues du iGRED (Clermont-Ferrand), partenaires du projet INVATRANSPO. Un deuxième aspect du projet est d’utiliser une approche de génomique comparative afin d’identifier d’autres facteurs génétiques impliqués dans la spécialisation sur les différents hôtes, en particulier au niveau du virus endogène (bracovirus) associé à ces espèces et impliqué dans la réussite parasitaire.
Le/la candidat(e)s doivent avoir une très bonne compétence en bio-informatique : assemblage et analyse des génomes et l’expérience de l’utilisation d’un cluster de calcul (SLURM) des logiciels REPET PanREPET et sRNAPipe ainsi que de l’annotation de piRNA cluster et de virus endogènes. L’Institut de Recherche sur la Biologie de l’Insecte (IRBI) se consacre à l’analyse des interactions entre les insectes et leur environnement biotique et abiotique. L'institut s'appuie également sur les compétences de nombreux post doctorants et chercheurs contractuels ainsi que 18 doctorants pour un effectif global de 75 personnes. Informations complémentaires
Expérience souhaitée : Expérience en assemblage et analyse bio-informatique des génomes d’hyménoptères.
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