Concevoir, développer, adapter et expérimenter de nouvelles méthodologies dans le cadre des projets de recherche concernant les interactions Vivant-Métaux chez les archées hyperthermophiles marine de l’ordre des Thermococcales.
Ces développements permettront de caractériser les structures minéralisées à différentes échelles pour mieux cerner les processus de nucléation, croissance et organisation des phases minérales, de distinguer les signatures minérales et élémentaires spécifiques aux interactions entre les cellules et l’environnement minéral et établir des protocoles standardisés de préparation et d’analyse MEB et FIB-SEM pour les échantillons biologiques et minéralisés.
Activités
- Assurer les préparations des échantillons biologiques et minéralisés pour les observations en microscopie électronique à balayage (MEB), en respectant les contraintes liées aux échantillons (déshydratation, métallisation…).
- Effectuer les observations et caractérisations des échantillons au MEB.
- Développerez des protocoles d’analyses quantitatives élémentaires sur les échantillons minéralisés au MEB, via la spectrométrie (EDS), en optimisant les paramètres d’analyse (résolution spatiale et étalonnage).
- Mettre en place, les protocoles de préparation d’échantillons pour le FIB-SEM (Focused Ion Beam), en vue de coupes fines de zones minéralisées. L’enjeu de ce projet est de permettre une meilleure compréhension des interfaces cellule/minéral.
- Former les utilisateurs aux bonnes pratiques de préparation des échantillons.
- Participer à la rédaction de protocoles, rapports techniques, publications scientifiques en lien avec l’imagerie et les analyses des échantillons minéralisés.
- Présenter, diffuser et valoriser les réalisations
- Participer à la rédaction des livrables et aux réunions de projet.
- Assurer et structurer une veille technologique
Compétences
- Titulaire d’un doctorat en microbiologie
- Connaissances approfondies en interactions métaux-microorganismes
- Connaissances générales en microscopie électronique à balayage
- Connaissances générales en analyse et traitement de données, électronique
- Techniques de présentation écrite et orale
- Langue anglaise : B2 à C1 (cadre européen commun de référence pour les langues)
- Planifier et gérer son activité
- Réglementation en matière d'hygiène et de sécurité
- Qualités : créativité, autonomie, rigueur, organisation et sens critique. Capacité à travailler dans un environnement multidisciplinaire.
Contexte de travail
L’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), unité mixte de recherche CEA, CNRS et Université Paris-Saclay rassemble de nombreuses équipes de recherche travaillant sur tous les aspects de la cellule, des constituants cellulaires jusqu'à l'interaction des cellules entre elles. L'institut se divise en cinq départements de recherche. Le département de Microbiologie s'intéresse quant à lui différents organismes, tels les bactéries, les archées et leurs virus, aussi bien pour leurs spécificités qu'en tant que modèles pour étudier les mécanismes biologiques. http://www.i2bc.paris-saclay.fr/
L’agent sera rattaché à l’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), au sein du département de Microbiologie, dans l'équipe de Biologie Cellulaire des Archées.
Les préparations des échantillons biologiques et minéralisés se feront dans l’équipe de Biologie Cellulaire des archées et sur la plateforme de microscopie électronique pour les coupes FIB-SEM. Les observations et analyses des échantillons biologiques et minéralisés seront réalisées sur la plateforme de microscopie électronique à balayage (détecteur EDS) de l’Institut de minéralogie, de physique des matériaux et de cosmochimie (IMPMC) de Sorbonne Université.
Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.
L’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), unité mixte de recherche CEA, CNRS et Université Paris-Saclay rassemble de nombreuses équipes de recherche travaillant sur tous les aspects de la cellule, des constituants cellulaires jusqu'à l'interaction des cellules entre elles. L'institut se divise en cinq départements de recherche. Le département de Microbiologie s'intéresse quant à lui différents organismes, tels les bactéries, les archées et leurs virus, aussi bien pour leurs spécificités qu'en tant que modèles pour étudier les mécanismes biologiques. http://www.i2bc.paris-saclay.fr/
L’agent sera rattaché à l’Institut de Biologie Intégrative de la Cellule (I2BC), au sein du département de Microbiologie, dans l'équipe de Biologie Cellulaire des Archées.
Les préparations des échantillons biologiques et minéralisés se feront dans l’équipe de Biologie Cellulaire des archées et sur la plateforme de microscopie électronique pour les coupes FIB-SEM. Les observations et analyses des échantillons biologiques et minéralisés seront réalisées sur la plateforme de microscopie électronique à balayage (détecteur EDS) de l’Institut de minéralogie, de physique des matériaux et de cosmochimie (IMPMC) de Sorbonne Université.
Le poste se situe dans un secteur relevant de la protection du potentiel scientifique et technique (PPST), et nécessite donc, conformément à la réglementation, que votre arrivée soit autorisée par l'autorité compétente du MESR.
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