Date Limite Candidature : lundi 4 novembre 2024 23:59:00 heure de Paris
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Informations générales
Intitulé de l'offre : Ingénieur en expérimentation et instrumentation biologique (H/F)
Référence : UMR7252-BENWET-008
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : LIMOGES
Date de publication : lundi 14 octobre 2024
Type de contrat : CDD Technique/Administratif
Durée du contrat : 8 mois
Date d'embauche prévue : 1 janvier 2025
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : Entre 2349,06 € et 2957,71 € bruts mensuels selon expérience
Niveau d'études souhaité : Niveau 6 - (Bac+3 ou 4)
Expérience souhaitée : Indifférent
BAP : Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement
Emploi type : Ingénieur-e en expérimentation et instrumentation biologiques
Missions
L'ingénieur consacrera son temps à une nouvelle activité de recherche exploitant le développement de « sources photoniques intelligentes » pour la mise en œuvre de nouvelles techniques d'imagerie multiphotonique.
Ses missions seront :
* Développer et conduire des approches méthodologiques en imagerie photonique (microspectroscopie multiphotonique de fluorescence et vibrationnelle) appliquées à des questions biologiques.
* Fonction support dans la mise en œuvre et le développement de systèmes d'imagerie photonique innovants au sein d'XLIM dans le cadre du projet ERC STREAMLINE.
Activités
Piloter des expérimentations en microscopie multimodale :
* Concevoir un plan d'expérience
* Acquérir des données notamment hyperspectrales
* Organiser la gestion des données générées (banque d'images, sauvegarde)
* Réaliser la métrologie de l'instrumentation
Analyser des données recueillies :
* Utiliser des logiciels de visualisation (ImageJ, ... )
* Utiliser des logiciels pour de l'analyse multivariée (Matlab, R, ... )
* Utiliser des approches d'analyse d'images par IA
Préparer des échantillons :
* Réaliser des coupes histologiques (sur organes inclus en paraffine ou congelés)
* Réaliser des colorations histologiques et des immunomarquages
* Adapter la préparation de l'échantillon à l'instrumentation utilisée
Conseiller les utilisateurs :
* Réaliser la veille technologique et scientifique
* Assister les utilisateurs dans la préparation des échantillons
* Accompagner les utilisateurs dans le traitement des données
* Rédiger des rapports, des notes de synthèse
Compétences
Savoirs :
* Connaissance approfondie en biologie
* Connaissance en microscopie et en analyse d'images
* Connaissances en informatique appliquée à la biologie
* Connaissances en optique ou systèmes photoniques
* Maitriser les analyses statistiques
* Maitriser l'expression orale et écrite en langue anglaise
Savoir-faire :
* Savoir piloter un microscope multimodal combinant microscopie de fluorescence et microspectroscopie vibrationnelle à détection hyperspectrale
* Traiter des données d'imagerie hyperspectrale (ou multidimensionnelle/multiimodale)
* Maitriser les coupes au microtome, les colorations et les immunomarquages de tissus et d'organismes biologiques
Savoir-être :
* Capacité à travailler en autonomie (sens de l'organisation, polyvalence, adaptabilité) aussi bien qu'en équipe (sens relationnel)
* Capacité de travailler dans un environnement transdisciplinaire et d'interagir avec des spécialistes d'autres disciplines scientifiques que la sienne (curiosité scientifique, ouverture d'esprit)
Contexte de travail
Le candidat retenu intégrera l'Institut de Recherche Xlim sur le site géographique de Limoges (France), ville de 130 000 habitants au cœur de la Région Nouvelle-Aquitaine reconnue pour sa qualité de vie. Xlim est une unité mixte de recherche multidisciplinaire (UMR - CNRS 7252), en association avec le Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS). L'Institut rassemble plus de 500 universitaires, chercheurs, personnels techniques et doctorants avec des expertises couvrant de vastes domaines de l'électronique et des micro-ondes, de l'optique et de la photonique, des mathématiques, de l'informatique et du traitement d'image.
L'ingénieur sélectionné rejoindra le Département Photonique de Xlim. Il mènera des recherches à l'interface de l'équipe PhoCal (Sources laser & Contrôle cohérent) et de l'équipe BioPhot (Biophotonique & Imagerie) dans le cadre d'un projet ERC Starting Grant (STREAMLINE – 2021-2026). Le candidat intégrera un groupe international et dynamique qui comprendra plusieurs postdocs et doctorants travaillant conjointement sur le projet pendant toute la durée de la thèse.
Contraintes et risques
* Le laboratoire est équipé de lasers femtosecondes (Classe 3) pour lesquels des protections adaptées sont prévues.
* Ambiance de travail bruyante
* Rayonnements Laser*
* Travail sur écran
* Multiples lieux de travail
* Déplacements/Missions
* Agent Chimique Dangereux
* Agents biologiques Groupe 2
* Agents biologiques Groupe 3
* Echantillons humains / animaux
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