Votre mission sera d'adapter et de mettre en oeuvre les approches méthodologiques de préparation des échantillons biologiques (cellules, sphéroïdes, tissus, fluides biologiques, sécrétomes, exosomes, éluats d'immunoprécipitations, etc.) pour permettre leur analyse protéomique par spectrométrie de masse dans le cadre de l'activité de service de la plateforme OncoProt.
Ces approches méthodologiques de préparation de tissus, isolation/collectes de structures ou de clusters cellulaires nécessitent l'utilisation de différents domaines d'activité de la plateforme (histologie, imagerie, microdissection laser), en collaboration avec les responsables de plateformes de TBMCore et de l'Institut Magendie et les utilisateurs de la plateforme.
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Vous mettrez en oeuvre les méthodes de déparaffinage, découpe laser, extraction protéique, réversion de fixation, dessalage et digestion trypsique des protéines. Pour chaque projet de recherche des utilisateurs, l'objectif sera d'optimiser l'identification et la quantification des protéines qui se fera ensuite par spectrométrie de masse. Vous utiliserez un robot d'ultrasonication focalisé (Covaris R320) et un robot pipeteur (Biomek I5) récemment acquis sur la plateforme et pour lequel vous devrez adapter les méthodes selon les projets des utilisateurs.
# Analyses et expérimentations
· Vous participez aux échanges avec les utilisateurs de la plateforme sur les spécificités des échantillons tissulaires selon les objectifs de leur projet de recherche
· Vous réalisez, en adaptant les conditions d'expérience, les techniques d'expérimentation pour la préparation d'échantillons biologiques pour l'analyse protéomique
· Vous adaptez et mettez en oeuvre les protocoles de préparation tissulaire, extraction protéiques et méthodes de commandes de robots adaptés à l'analyse protéomique par spectrométrie de masse
· Vous prenez en main les robots de préparation des échantillons disponibles sur la plateforme OncoProt (Covaris R320 et BioMek i5), participez au suivi d'utilisation, d'entretien et de maintenance
· Vous partagez vos connaissances aux utilisateurs sur les techniques de préparation des échantillons biologiques : méthodes d'extraction et de préparation des protéines, microdissection laser
# Vie du laboratoire
· Vous animez des actions de formation sur l'analyse protéomique des supports biologiques dans le cadre de formations à des étudiants ou du personnel de recherche
· Vous rédigez des rapports d'expériences ou d'études, des notes techniques
· Vous participez à la démarche qualité ISO9001 et au suivi métrologique des équipements, et êtes garant de la bonne application des règles d'éthique, d'hygiène et de sécurité
· Vous supervisez les plannings d'utilisation des ressources
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