Vous intégrerez une équipe pluridisciplinaire, et participerez à des activités de recherches en bioinformatiques afin de faciliter la compréhension des effets d'une exposition accidentelle à des rayons ionisants.
L'objectif principal de ce stage est d'identifier des fonctions biologiques impliquées dans la réponse aux rayons ionisants dans des données transcriptomiques à l'aide d'outils topologiques. Dans un premier temps, le candidat devra prendre en main plusieurs de ces outils d'enrichissement, en passant par le package R graphite, et les bases de données qui leur sont associées (KEGG, WikiPathways, Reactome, etc.), et appliquer ces méthodes sur des données transcriptomiques obtenues dans les conditions irradié vs control afin de caractériser la réponse aux rayons ionisants. Dans un second temps, l'étudiant aura l'occasion d'implémenter une interface R shiny qui facilitera l'accès aux outils d'enrichissement par les autres membres du laboratoire dans le cadre de divers projets.
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