À propos de nous
L’université de Franche-Comté est une université pluridisciplinaire qui accueille chaque année près de 27 000 apprenants sur six sites : Besançon, Belfort, Montbéliard, Vesoul, Dole et Lons-le-Saunier.
Avec ses 19 unités de recherche, dont 7 UMR, 5 structures fédératives et ses 27 plateformes technologiques, l’université de Franche-Comté place au cœur de sa stratégie l’articulation formation-recherche-innovation.
Engagement, excellence, qualité, histoire, ouverture et progrès : l’université de Franche-Comté porte six valeurs fortes que la communauté universitaire promeut au quotidien dans ses formations et dans la vie étudiante.
Une recherche de haut niveau s’y développe pour répondre aux grands défis sociétaux. Labellisée HRS4R et membre du réseau EURAXESS, elle est reconnue pour assurer un accueil de qualité à ses chercheurs. Elle possède également le label Bienvenue en France, reconnaissance de son rayonnement à l’international.
Ouverte sur le monde et profondément ancrée dans son territoire, elle est un acteur économique capital de son environnement.
Macha Woronoff, professeur d’université en pharmacie clinique et praticien hospitalier au CHU de Besançon, préside l’Université.
Mission
Vous recherchez des missions passionnantes et innovantes qui ont du sens et vous souhaitez vivre une expérience professionnelle avec de vrais challenges ?
Alors rejoignez l’Université de Franche-Comté, acteur majeur de la formation, recherche et de l’innovation.
Au sein de l'Université de Franche-Comté Santé, l'ingénieur biologiste en traitement de données H/F est en charge de la recherche sur la plateforme Bio-informatique et Big data au Service de la Santé (2B2S).
Mission 1 : Développement et montage de projets en lien avec les biologistes
* Développement de nouveaux outils et pipelines d’analyses de données de NGS répondant aux besoins des équipes partenaires
* Participation au montage des projets biologiques (notamment sur les besoins en données et les techniques nécessaires)
Mission 2 : Administration système
* Administration d'un serveur de calcul sous linux (Mise à jour, gestion des droits, suivi du stockage)
* Webmaster du site web de la plateforme.
Mission 3 : Traitement des données de NGS en biologie médicale
* Analyse de données de NGS en biologie (traitements des données brutes, stockage, alignement, assemblage)
* Analyse des microbiotes humains et environnementaux
* Analyse des données de RNAseq, de ChIP-Seq
* Analyse de données de protéomique
* Appel de variants chez les procaryotes et les eucaryotes (bactéries, parasites, champignons, virus, cellules cancéreuses)
* Association des données biologiques et des données patients.
Compétences nécessaires:
* Maîtrise de plusieurs outils de programmation
* Maîtrise de l’anglais
* Solides notions en biologie
* Connaissance en administration linux
* Connaissance en analyse statistique
L'ingénieur biologiste H/F sera en contact régulier avec différents interlocuteurs:
* Directeur de la plateforme
* Autres ingénieurs du comité technique
* Comité de pilotage scientifique – directeur(rice)s des équipes partenaires
* Equipe informatique de l’UFR Santé
* Stagiaires de la plateforme
L'ingénieur biologiste H/F pourra être amené à encadrer 2 stagiaires maximum durant l'année.
Profil
Compétences nécessaires:
- Maîtrise de plusieurs outils de programmation
- Maîtrise de l’anglais
- Solides notions en biologie
- Connaissance en administration linux
- Connaissance en analyse statistique
Qualités requises:
- Autonomie
- Travail en groupe
- Forte capacité d'initiative
- Curiosité
- Sens de l'organisation
- Sens de la communication
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