Durée du contrat : 1 an
L’UMS : France Cohortes constitue une plateforme nationale de services aux cohortes inscrite sur la feuille de route nationale des infrastructures de recherche. Cette infrastructure distribuée associe plusieurs tutelles académiques dans le cadre d’une unité mixte de services (UMS). France Cohortes vise à apporter des services mutualisés aux cohortes épidémiologiques sur les aspects réglementaires, de système d’information, et sur les outils, méthodes et standards adéquats de production, de diffusion et d’exploitation de données. L’UMS France Cohortes est structurée d’une cellule centrale coordonnant plusieurs cellules de site.
Au sein des tutelles et partenaires de France Cohortes, plusieurs équipes mettent en place des études épidémiologiques longitudinales couvrant à la fois des champs de la recherche fondamentale, de la recherche clinique et de la santé publique dans le but de faire progresser la connaissance. Ainsi y sont menés des projets de recherche ayant des implications immédiates sur la prise en charge des patients et les processus de prise de décisions des politiques de santé, mais également des projets visant à mieux caractériser les facteurs de risque environnementaux, sociaux et génétiques de survenus et d’évolution des maladies. Un grand nombre de ces projets de recherches sont basés sur des cohortes en population générale ou clinique. Certaines de ces études sont d’ores et déjà chainées au Système National des Données de Santé (SNDS) et d’autres devraient l’être très prochainement. Un soutien statistique de haut niveau est fondamental pour mettre en œuvre rapidement les projets de recherche et guider les équipes dans la réalisation des analyses.
Missions et positionnement de l’agent·e :
France Cohortes souhaite renforcer son soutien méthodologique aux équipes en charge de cohorte et aux chercheurs·es souhaitant traiter les données, chainer les données au SNDS, ou partager les données afin de faciliter la mise en œuvre de traitement de données très hétérogènes, en grande dimension, faisant intervenir des méthodes d’inférence causale ou d’apprentissage statistique, sur le SNDS ou les infrastructures de France Cohortes.
L’expert·e en information statistique sera placé·e sous la responsabilité hiérarchique de la direction de France Cohortes.
Activités principales :
L’expert·e en information statistique apportera son expertise méthodologique auprès des chercheurs·ses et ingénieurs·es analysant et documentant les données au sein de France Cohortes. En particulier, il/elle apportera son expertise méthodologique sur les traitements relatifs au SNDS.
Il/Elle déclinera les activités suivantes :
* Assurer et coordonner une veille scientifique, l’expression de besoin et/ou le développement et la maintenance des méthodes et outils d'exploitation des données longitudinales à des fins de description, de prédiction ou d’inférence causale, en collaboration avec les agents·es de France Cohortes et les ingénieurs·es et chercheurs·ses travaillant sur les données des cohortes et de l’ensemble du SNDS,
* Animer des partenariats avec des équipes de recherche du domaine en France et à l’international,
* Coordonner et organiser l’animation et la formation de la communauté des statisticiens et data scientists autour de l’exploitation des données longitudinales en présence de données riches (notamment cohortes et SNDS) et avec le recours aux méthodes (intelligence artificielle) et infrastructures (GPU) de la science des données,
* Participer au recueil du besoin et des questions émanant de chercheurs·ses concernant la mise en œuvre de démarche de science des données, pour orienter sur l’utilisation d’outils et de méthodes adaptés, et rédiger des expressions de besoins pour améliorer les infrastructures de France Cohortes,
* Mettre en cohérence la démarche méthodologique de l'inférence causale et de l'apprentissage statistique avec les enjeux de la documentation et de la qualité des données en vie réelle, et ainsi contribuer, en collaboration avec les experts du domaine au sein des cohortes à la dissémination de la démarche FAIR,
* Élaborer et réaliser des programmes permettant d’automatiser certains traitements communs à toutes les cohortes,
* Assurer une veille méthodologique et rédiger des fiches méthodologiques,
* Identifier, analyser et comprendre les besoins,
* Effectuer des présentations et des formations pour assurer un transfert de compétences.
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