Doctorant f/h théorie des bandits pour le suivi personnalisé de patients.

Contexte et atouts du poste

Le projet BIP-UP financé par l'ANR débute le 1er janvier 2023 et durera 4 années. BIP-UP s'appuie sur une collaboration existant depuis plusieurs années entre l'équipe Inria Scool, dirigée par Philippe Preux et l'unité INSERM 1190 localisée au CHU de Lille, dirigée par François Pattou, tous deux professeurs à l'Université de Lille.
Cette collaboration a pour objectif d'étudier l'exploitation de données de santé pour le suivi personnalisé de patient après intervention chirurgicale. L'espoir est que les données de santé collectées par différents acteurs permettent de passer d'un protocole de suivi identique pour tous les patients à un protocole personnalisé qui, en étant adapté à chaque patient, serait mieux suivi par les patients, avec donc un meilleur bénéfice pour leur santé.
Débutée en 2019, cette collaboration a déjà porté ses fruits. D'une part, ces 3 années de travail nous ont permis de mieux identifier et caractériser les problèmes à aborder et des voies pour les aborder. D'autre part, outre des personnels permanents dans les deux équipes, un ingénieur, un doctorant et un post-doc ont réalisé des travaux préliminaires significatifs.
Un aspect particulièrement passionnant de ce contexte de travail est l'ancrage sur le terrain puisque l'équipe INSERM est en contact direct avec des patients (consultation, opération, suivi) et est bien entendu experte sur les aspects médicaux liés à la pathologie opérée.

Mission confiée

Nous avons exprimé le problème à résoudre sous la forme d'un problème de bandit particulier. Ses caractéristiques principales sont~: problème de bandit contextuel, nécessitant la prise en compte du risque (pour le patient), absence de simulateur pour entraîner les algorithmes et données disponibles en quantité limitée, une distribution des retours non gausienne.
Sans que cela ait clos ces sujets, la thèse en cours (Patrick Saux, 2020--2023) a permis d'avancer sur le sujet de la prise de risque et des distributions de retours non gausiennes. La prise en compte du risque demeure un sujet sur lequel il reste beaucoup à faire. De nombreux points restent à définir et travailler dans le projet BIP-UP :

1. modélisation précise comme un problème de bandits ; ce point inclut la définition opérationnelle de la notion de récompense.
2. développement de la théorie sur les, ou certains des, aspects cités ci-dessus caractérisant le problème concret étudié.
3. étude de la mise en pratique en tenant compte des données dont nous disposons et des données dont on pourrait disposer.
4. conception/réalisation d'une preuve de concept.

Principales activités

activités de recherche menant à l'obtention d'un diplôme de doctorat.

Compétences

Nous attendons des candidatures provenant de personnes ayant un master 2 ou un diplôme d'ingénieur. Une partie importante de la formation suivie est constituée d'apprentissage automatique, théorie de la prise de décision séquentielle dans l'incertain (bandit, apprentissage par renforcement).

La candidature idéale pour cette thèse allie :

5. de bonnes connaissances en probabilités et en statistiques seront nécessaires pour étudier formellement les propriétés et les garanties que l'on peut obtenir pour les algorithmes qui seront proposés. Des connaissances sur la théorie des bandits ou l'apprentissage par renforcement seront un plus pour la candidature.
6. un intérêt, et des connaissances, pour l'analyse de données médicales qui peuvent être utilisées pour entraîner les algorithmes de bandits. Des connaissances dans toutes les méthodes de fouille de données (apprentissage supervisé et non supervisé) sont donc plus que bienvenues. Ainsi, une bonne connaissance de R ou de python avec ses paquetages d'analyse de données est plus que bienvenue.

Lecture de l'anglais indispensable et capacité à présenter à l'oral et par écrit en anglais nécessaires.

Avantages

7. Restauration subventionnée
8. Transports publics remboursés partiellement
9. Congés: 7 semaines de congés annuels + 10 jours de RTT (base temps plein) + possibilité d'autorisations d'absence exceptionnelle (ex : enfants malades, déménagement)
10. Possibilité de télétravail et aménagement du temps de travail
11. Équipements professionnels à disposition (visioconférence, prêts de matériels informatiques, etc.)
12. Prestations sociales, culturelles et sportives (Association de gestion des œuvres sociales d'Inria)
13. Accès à la formation professionnelle
14. Sécurité sociale

Rémunération

1ère et 2ème année : 2051 € mensuel brut

3ème année : 2158 € mensuel brut