Mission :
L'ITA recruté/e sera intégré dans l'équipe de bioinformatique du Laboratoire MMSB (UMR 5086 ; équipe MOMS). Il aura une double mission visant à (1) assurer le développement et la maintenance des outils bioinformatiques pour la simulation des protéines au niveau gros-grain (champ de force Martini 3) ; (2) contribuer aux différents tâches prévues dans le cadre du projet ANR SELDOM.
Le poste proposé est un temps incomplet à 70%.
Activités :
La personne recrutée aura la charge de :
- Contribuer aux différentes tâches liées à la modélisation des protéines membranaire, utilise dans plusieurs projets dans l'equipe MOMS.
- Développer et implémenter des algorithmes pour la préparation des simulations gros-grain avec le champ de force Martini.
- Contribuer au développement du champ de force Martini 3 pour les lipides neutres (esters du cholesterol) et des protéines ; en particulier, l'ITA recruté/e s'occupera de l'optimisation du backbone des protéines.
- Développer et implémenter de nouvelles méthodologies pour l'analyse des trajectoires de simulations moléculaires, réalisées par l'équipe MOBI.
- Développer des tutoriels pour illustrer e fonctionnement des différentes outils bioinformatiques utilisé dans l'équipe, et le partager sur le site GitHub de l'équipe.
- Former les nouveaux arrivants de l'équipe MOBI aux bonnes pratiques de programmation, à l'utilisation des ressources informatiques disponibles dans l'équipe (y inclus GitHub), et au stockage des données.
Experience: Débutant accepté
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