Ingénieur-e de recherche en modélisation moléculaire h/f

Ingénieur-e de recherche en Modélisation moléculaire H/F

Date Limite Candidature : jeudi 16 janvier 2025 00:00:00 heure de Paris


Informations générales

Réservé uniquement aux agents CNRS (fonctionnaires et CDI)
Intitulé de l'offre : Ingénieur-e de recherche en Modélisation moléculaire H/F
Référence : UMR6296-MOBINT-J52013
Lieu de travail : AUBIERE
Institut : INC - Institut de chimie
Date de publication : mercredi 4 décembre 2024
Session : Campagne Hiver 2025
Groupe de Fonction : IRG3
BAP : B - Sciences chimiques et Sciences des matériaux
Emploi type : Ingénieur-e de recherche en science des matériaux / élaboration


Missions

L'ingénieur(e) de recherche sera chargé(e) d'élaborer des modèles moléculaires pour explorer, prédire et optimiser les propriétés structurales et fonctionnelles de protéines, peptides, peptoïdes et molécules organiques. Il / elle aura pour mission de travailler étroitement avec l'équipe « Chimie Organique et Médicinale » de l'ICCF sur des projets à l'interface Chimie-Biologie, portant notamment sur l'analyse conformationnelle de molécules/foldamères, l'interaction récepteur/ligand, enzyme/substrat ou protéine/protéine et sur la réactivité chimique et biochimique. Il / elle devra assurer une veille technologique et scientifique pour intégrer les dernières avancées en modélisation moléculaire, tout en proposant des solutions innovantes répondant aux besoins des projets. Il / elle devra contribuer à la rédaction de publications scientifiques, de rapports techniques et de documents de présentation pour valoriser les résultats obtenus.


Activités

- Construire des modèles de cibles biologiques à partir de données cristallographiques ou par homologie
- Conduire des analyses conformationnelles (molécules / oligomères / foldamères)
- Analyser les résultats issus des simulations en termes de propriétés chimiques / électroniques / réactivité
- Étudier les interactions moléculaires via des techniques de dynamique moléculaire / docking / QSAR pour évaluer les affinités et modes d'action potentiels entre protéine-protéine ou protéine-ligand.
- Simuler la réactivité chimique et biochimique des systèmes étudiés en utilisant la dynamique quantique, la théorie de la fonctionnelle de la densité (DFT) et les approches hybrides QM/MM.
- Diffuser et valoriser les résultats de recherche
- Encadrer / former des doctorants ou stagiaires
- Assurer une veille scientifique et technologique


Compétences

- Maitrise des outils de modélisation moléculaire : simulation tout atome que ce soit dans le cadre des approches quantiques, classiques ou hybrides (QM/MM)
- Capacité de travailler de manière autonome dans un environnement LINUX
- Aptitude à installer, configurer et gérer les logiciels de modélisation moléculaire sur des infrastructures de calcul partagées, notamment au sein du Mésocentre Clermont Auvergne.
- Goût affirmé pour le travail en équipe
- Capacité à accompagner le développement de compétences des membres du service et de l'équipe COM.
- Savoir-être : rigueur / fiabilité, sens de l'initiative et de l'organisation, capacité d'adaptation et de conceptualisation


Contexte de travail

La modélisation moléculaire est devenue un outil incontournable pour répondre aux problématiques de recherche au sein de l'ICCF, comme en témoignent le nombre de publications et les demandes d'études par modélisation moléculaire en forte augmentation. Face à cette demande croissante, les capacités de calcul ont été considérablement renforcées au cours des cinq dernières années, avec l'ajout de serveurs GPU et l'accès aux infrastructures du Mésocentre Clermont Auvergne. Désormais, la limite réside dans les capacités humaines, ce qui motive le recrutement d'un ingénieur de recherche spécialisé en modélisation moléculaire. Au sein du laboratoire, le poste sera mutualisé entre l'équipe COM (50%) et le service de modélisation moléculaire (50%) sous la responsabilité de l'IR responsable de ce service. L'ingénieur-e sera intégré-e à 50% à l'équipe « Chimie organique et médicinale » (COM), créée en janvier 2017, qui rassemble 14 enseignants-chercheurs (5 professeurs et 9 maîtres de conférences) ainsi que 2 chercheurs CNRS (2 directeurs de recherche). Cette équipe développe des projets à l'interface Chimie-Biologie et se concentre sur la conception, la synthèse et l'analyse de molécules ciblant des cibles thérapeutiques innovantes. L'équipe COM est également affiliée au Centre International de Recherche (CIR) « Mobilité personnalisée comme facteur-clé de la santé » dans le cadre du programme I-SITE Clermont CAP 2025, une reconnaissance nationale qui accentue son rôle dans le développement de nouvelles approches thérapeutiques. L'équipe souhaite renforcer ses capacités en modélisation moléculaire par le recrutement d'un ingénieur de recherche, dont l'expertise viendra soutenir les projets de développement de nouveaux principes actifs et l'identification de nouvelles cibles thérapeutiques. L'ingénieur-e pourra également s'appuyer sur l'expérience acquise dans ces domaines par le service de modélisation moléculaire de l'ICCF qu'il intégrera à 50 %.

#J-18808-Ljbffr