L'Institut Pasteur conduit des recherches biomédicales de pointe et avant-gardistes depuis plus de 130 ans.
Sur notre campus de 5 hectares en plein Paris (15è arrondissement), dans un environnement multiculturel et stimulant, 3000 personnes collaborent pour répondre aux ambitions de l'Institut Pasteur.
Dans le cadre de la surveillance épidémiologique des bactéries pathogènes et de l'harmonisation des taxonomies génomiques des souches bactériennes, nous recherchons un data manager, dont le rôle sera de contribuer à la curation des données intégrées à la plateforme de librairies génomiques BIGSdb-Pasteur, et d'aider à les analyser et à valoriser.
Missions :
Sous la supervision du coordinateur du projet BIGSdb-Pasteur (Pr Sylvain Brisse) et du coordinateur des curateurs (Martin Rethoret-Pasty) et en interaction avec la plateforme de Data Management (Anne-Caroline Deletoille), le Data Manager sera responsable des tâches suivantes :
- Curation des données : interaction par e-mail (en anglais) avec les fournisseurs de données, contrôles de qualité, intégration des données.
- Échange de données avec d'autres plateformes d'épidémiologie génomique telles que pathogenwatch et PubMLST (Oxford).
- Mise à jour et harmonisation des données des champs qui le nécessitent ;
- Tests de nouvelles fonctionnalités de la plateforme BIGSdb ;
- Participation à la mise à jour des procédures de gestion des données et à l'élaboration de lignes directrices sur les meilleures pratiques.
- Contrôles la littérature scientifique pour les isolats importés dans la base de données.
- Contributions éventuelles à l'analyse et à la dissémination (publications, mailings) des taxonomies génomiques hébergées dans BIGSdb-Pasteur.
Contrat en CDD (12 mois)
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