Mission :
Développer un ensemble de logiciels pour l'analyse et la reconstruction 3D des données de microscopie par localisation de molécules uniques (SMLM).
Activités :
Développer un ensemble d'outils informatiques dédiés à l'analyse et la reconstruction de données de microscopie SMLM dans le logiciel Napari (https://napari.org). Porter les codes existants du laboratoire (ondelettes, fit Gaussien, tracking développés en C/C++), et implémenter de nouvelles approches développées au sein d'autres laboratoires (spline, UI-PSF, etc.), en CPU et GPU. Effectuer une évaluation systématique des performances de chaque algorithme. Réaliser de la veille bibliographique et s'intéresser aux solutions d'acquisition permettant dans une seconde étape de réaliser de l'analyse SMLM en temps réel. Travail en autonomie sur projet principal et en équipe sur projets collaboratifs.
Experience: Débutant accepté
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