Ingénieur en machine learning junior pour l'ia en santé h/f

Job details
Job Type
Temporary
Contract

Full Job Description

Type de contrat : CDD

Contrat renouvelable : Oui

Niveau de diplôme exigé : Bac +5 ou équivalent

Autre diplôme apprécié : Doctorat en apprentissage automatique

Fonction : Ingénieur scientifique contractuel

Niveau d'expérience souhaité : Jusqu'à 3 ans

Contexte et atouts du poste
Ce poste d'ingénieur en Machine Learning junior (~0 à 3 années d'experience) est lié au domaine de la santé numérique qui est au croisement des sciences du numérique et de la santé.

Il se déroulera au sein de l'équipe HeKA qui est commune à Inria Paris (https://www.inria.fr/fr/centre-inria-de-paris) et au Centre de Recherche des Cordeliers (UMR 1138 commune à l'Inserm et l'Université de Paris, http://www.crc.jussieu.fr/). Ses interactions fortes et uniques avec Inria, Inserm et l'AP-HP font de HeKA un environnement d'excellence de recherche pour le développement de projets en santé numérique, avec un impact réel sur la pratique clinique. Les membres d'HeKA s'intéressent à la valorisation de grands ensembles de dossiers patients informatisés (DPI) mis à disposition dans les entrepôts de données de santés.

L'ingénieur·e sera encadré·e par Antoine Neuraz (MD, PhD) et Adrien Coulet (PhD), tous deux chercheurs en informatique médicale et santé numérique et nécessitera des interactions avec de nombreux membres de l'équipe chercheurs, doctorants, internes en médecine, avec les ingénieurs de l'équipe SED (Service d'Expérimentation et de Développement) d'Inria et ceux de l'AP-HP.

L'objectif est l'intégration de modèles, notamment d'apprentissage profond, entrainés sur différentes modalités (texte, audio, données structurés) au sein d'une même librairie Python open-source. Ce travail sera fait en collaboration étroite avec un ingénieur logiciel chargé du developpement de la librairie, dont le prototype a été developpé dans l'équipe.

La librairie a pour but de :

1) faciliter la manipulation (i.e., l'annotation, l'extraction, la transformation) de données de patients de différentes modalités : données structurées, textuelles, audio, et à plus long terme images, génétiques, etc. Des modules différents seront progressivement développés pour les différentes modalités.

2) proposer un module supplémentaire pour faciliter le développement et l'expérimentation de modèles de plus haut niveaux, entrainés à partir de données multimodales.

Mission confiée
L'ingénieur en Machine Learning aura pour rôle l'entraînement et l'évaluation des modèles, suivant des architectures développées par les chercheurs de l'équipe ou d'autres équipes, sur des bases de données open-source et/ou fermées provenant des dossiers patients des hôpitaux. Par exemple, un modèle Wav2vec2 pour l'audio, et un modèle BERT pour le texte. Il participera activement au choix des modèles, et si ses compétences le permettent, pourra proposer des architectures spécifiques.

Principales activités
Voir par ailleurs.

Compétences
Compétences essentielles :
- Python
- Connaissances des concepts de l'apprentissage automatique
- Expérience en apprentissage profond (PyTorch, Tensorflow, etc.)

Compétences additionnelles appréciées :
- Expérience sur les méthodes de traitement de données audio ou textuelles,
- Facilités pour la communication (travail en collaboration avec des experts médicaux, les ingénieurs de l'entrepôts de données de santé, les chercheurs de l'équipe HeKA)
- Expérience en architecture et génie logiciel (notamment en développement agile, encapsulation, gestion de versions)

Langues :
- La compréhension orale et écrite du français peut être un atout
- Anglais

Avantages- Restauration subventionnée
- Transports publics remboursés partiellement
- Congés : 7 semaines de congés annuels + 10 jours de RTT (base temps plein) + possibilité d'autorisations d'absence exceptionnelle (ex : enfants malades, déménagement)
- Possibilité de télétravail (après 6 mois d'ancienneté) et aménagement du temps de travail
- Équipements professionnels à disposition (visioconférence, prêts de matériels informatiques, etc.)
- Prestations sociales, culturelles et sportives (Association de gestion des oeuvres sociales d'Inria)
- Accès à la formation professionnelle

Rémunération
Selon profil et expérience