Post-doctorat (h/f) en métagénomique des communautés microbiennes digestives

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Post-doctorat (H/F) en métagénomique des communautés microbiennes digestives

Cette offre est disponible dans les langues suivantes :

Date Limite Candidature : jeudi 16 janvier 2025 23:59:00 heure de Paris
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Informations générales

Intitulé de l'offre : Post-doctorat (H/F) en métagénomique des communautés microbiennes digestives
Référence : UMR5023-CLEFRA-001
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : VILLEURBANNE
Date de publication : jeudi 26 décembre 2024
Type de contrat : Chercheur en contrat CDD
Durée du contrat : 30 mois
Date d'embauche prévue : 10 février 2025
Quotité de travail : Complet
Rémunération : à partir de 3022 € bruts mensuel selon expérience
Niveau d'études souhaité : Doctorat
Expérience souhaitée : Indifférent
Section(s) CN : 29 - Biodiversité, évolution et adaptations biologiques : des macromolécules aux communautés


Missions

Le projet de post-doctorat s'inscrit dans le cadre d’un projet ANR qui étudie l’influence du microbiote digestif des détritivores sur la décomposition des litières de feuilles dans les écosystèmes d’eau douce (projet DIET).
L’objectif de ce projet est d’évaluer l’influence du microbiote digestif des détritivores sur la décomposition de la litière végétale et sur les flux de carbone qui en découlent dans les milieux d’eau douce. Pour cela, la personne recrutée appliquera des approches de métagénomique et d’isotopie sur les communautés microbiennes digestives d’isopodes détritivores.


Activités

1. Acquisition des données de métagénomique sur les communautés digestives d’isopodes collectés in situ.
2. Développement et mise en place du protocole d’ADN-SIP.
3. Expérimentations en conditions contrôlées et stériles.
4. Analyse des données de séquençage : caractérisation du répertoire fonctionnel des communautés digestives, focus sur les enzymes dégradant la lignocellulose (CAZymes).
5. Assurer la traçabilité et reproductibilité des analyses de biologie moléculaire et bio-informatiques.
6. Présentation des résultats, rédaction de publications.
7. Possibilité d’encadrer un ou une stagiaire de Master dans le cadre du projet ANR.


Compétences

Différents profils peuvent correspondre à ce poste :
- Solides compétences en biologie moléculaire appliquée aux nouvelles technologies de séquençage.
- Bases en bioinformatique, que vous souhaitez développer avec un appui en interne.
- Curiosité pour l’aspect interdisciplinaire du projet et l’envie de se former à de nouvelles approches.
- Aptitude à travailler en équipe et autonomie dans l’organisation du travail.

Une expérience en ADN-SIP, ainsi que des compétences en microbiologie, ne sont pas requises mais seront considérées comme des atouts.


Contexte de travail

La personne recrutée sera basée au LEHNA (Laboratoire d’Ecologie des Hydrosystèmes Naturels et Anthropisés) à l’Université Lyon 1, sur le campus de la Doua. Ce poste est à pourvoir pour une durée de 22 à 30 mois (selon expérience), financé dans le cadre d’un projet ANR JCJC (2023-2027). Le poste est à pourvoir à partir de Février 2025.

#J-18808-Ljbffr