L’Hôpital Fondation Adolphe de Rothschild est classé parmi les meilleurs hôpitaux français, une référence pour les pathologies Tête et Cou et une excellence médicale reconnue. Un hôpital qui s’engage auprès de ses équipes comme de ses patients.
Employeur responsable, nous vous proposons des parcours professionnalisant et une politique de formation ambitieuse et innovante.
Etablissement privé à but non lucratif, nous agissons en faveur du handicap et luttons contre les discriminations.
Travailler dans un environnement dynamique et humain dans lequel vous pourrez poursuivre l’apprentissage de votre métier vous motive : Apportez votre contribution, rejoignez-nous !
BRAINlab est une équipe de recherche multidisciplinaire qui mène des recherches de pointe dans les domaines de la neuro-opthalmologie et de l'informatique. L'équipe est dirigée par le professeur Dan Milea, neuro-ophtalmologue de renommée mondiale qui a mené des collaborations internationales clés sur l'intelligence artificielle médicale en neuro-ophtalmologie. Le BRAINlab est composé de 10 cliniciens, scientifiques de l'IA et épidémiologistes.
Description du stage et de ses missions :
Ce stage en informatique, avec possibilité de poursuivre en doctorat, se concentre sur le développement de biomarqueurs d'imagerie multimodaux pour la prédiction de la démence à l'aide d'images rétiniennes. La rétine, qui fait partie du système nerveux central, est considérée comme une fenêtre sur le cerveau, permettant l'imagerie de changements neurovasculaires subtils. Les biomarqueurs sont essentiels compte tenu de la prévalence croissante de la démence.
De nouvelles images rétiniennes à grande échelle ont été acquises dans un hôpital parisien et seront utilisées. Les modalités comprennent : des photos de fond d'œil ultra-large, la tomographie par cohérence optique et l'angiographie par tomographie par cohérence optique.
La tâche principale du stage est de développer un algorithme pour segmenter la vascularisation rétinienne en utilisant des méthodologies avancées de vision par ordinateur, telles que les transformateurs (par exemple, SAM, SAM2, DinoV2). Des milliers d'images sont disponibles.
Le lieu de travail sera une équipe de chercheurs de renommée internationale avec une expertise en informatique, ophtalmologie et neurologie (à l'hôpital de la Fondation Rothschild).
Ce stage est fait pour vous si :
Vous êtes actuellement en dernière année de Master ou école d'ingénieur avec une spécialisation en IA.
Vous êtes enthousiaste et motivé qui s'intéresse à la science de pointe et qui souhaite travailler avec des techniques d'analyse informatique de pointe et au sein d'équipes pluridisciplinaires de chercheurs cliniciens et informaticiens.
Nous recherchons un candidat ayant de l'expérience dans (la plupart des) programmes suivants:
* Programmation : Python, Jupyter Notebooks.
* Science des données : NumPy, Pandas, Scikit-learn, Matplotlib/Seaborn.
* Cadres d'IA et de vision par ordinateur : PyTorch, Hugging Face Transformers, OpenCV.
* Outils d'annotation : GroundingSAM, SAM, Labelme.
Des connaissances médicales préalables sont utiles, mais pas nécessaires.
Modalités de candidature
Veuillez envoyer un courriel avec en pièce jointe :
1) CV
2) motivation de ce qui vous intéresse dans le projet
3) expérience pertinente antérieure
Résumé scientifique
L'avènement récent des techniques d'imagerie ultra-large offre une possibilité révolutionnaire d'imagerie non invasive de la périphérie rétinienne. Dans le passé, les photos du fond d'œil permettaient d'imager jusqu'à 50 degrés de la rétine au pôle postérieur. Avec la nouvelle imagerie ultra-large, il est possible d'imager jusqu'à 200 degrés de la rétine (couvrant ~80% de la rétine entière).
Les changements rétiniens périphériques peuvent constituer un biomarqueur non invasif pour les maladies neurologiques telles que la maladie d'Alzheimer, le type de démence le plus courant. Les études neuropathologiques montrent que les plaques de bêta-amyloïde et de tau s'accumulent dans les régions périphériques de la rétine. On pense que l'accumulation de ces protéines est préjudiciable aux tissus neuronaux et microvasculaires de la rétine. La façon dont les vaisseaux rétiniens changent dans les régions périphériques de la rétine in vivo chez l'homme reste incomplètement comprise en raison du manque de données humaines à grande échelle.
L'un des principaux obstacles à l'analyse des photos dans les grandes études est l'absence de logiciel entièrement automatique pour classer les vesseaux. L'objectif de ce projet est de développer un algorithme pour la segmentation des vaisseaux sur des images à champ ultra-large.
Ensemble de données
-Etude CIRCAME-EYE (des milliers d'images, un nouveau jeu de données disponible à l'hôpital de la Fondation Rothschild)
Période de stage
Avril 2025 - octobre 2025, avec la possibilité de poursuivre un doctorat après le stage.
Organization:
BRAINlab is a multidisciplinary research team conducting cutting-edge research in the fields of neuro-ophthalmology and computer science. The team is led by Professor Dan Milea, a world-renowned neuro-ophthalmologist who has led key international collaborations on medical artificial intelligence in neuro-ophthalmology. The BRAINlab consists of 10 clinicians, AI scientists and epidemiologists.
The Rothschild Foundation is a leading clinical hospital specializing in neurological and ophthalmological diseases.
Intership :
This computer science internship, with the possibility of continuing to a PhD, focuses on the development of multimodal imaging biomarkers for the prediction of dementia using retinal images. The retina, part of the central nervous system, is seen as a window on the brain, enabling imaging of subtle neurovascular changes. Biomarkers are essential given the increasing prevalence of dementia.
New large-scale retinal images have been acquired in a Paris hospital and will be used. Modalities include: ultra-wide fundus photos, optical coherence tomography and optical coherence tomography angiography.
The main task of the internship is to develop an algorithm to segment the retinal vasculature using advanced computer vision methodologies, such as transformers (e.g. SAM, SAM2, DinoV2). Thousands of images are available.
The workplace will be a team of internationally renowned researchers with expertise in computer science, ophthalmology and neurology (at the Rothschild Foundation Hospital).
Candidate :
We're looking for an enthusiastic, motivated candidate with an interest in cutting-edge science, computational analysis techniques within a multidisciplinary team of clinical and computational researchers.
We are looking for a candidate with experience in (most of) the following programs:
Programming: Python, Jupyter Notebooks.
Data science: NumPy, Pandas, Scikit-learn, Matplotlib/Seaborn.
AI and computer vision frameworks: PyTorch, Hugging Face Transformers, OpenCV.
Annotation tools: GroundingSAM, SAM, Labelme.
Previous medical knowledge is useful, but not necessary.
How to apply
Please send an e-mail with the following attachments:
1) CV
2) motivation for your interest in the project
3) previous relevant experience
Scientific summary
The recent advent of ultra-wide imaging techniques offers a revolutionary opportunity for non-invasive imaging of the retinal periphery. In the past, fundus photographs imaged up to 50 degrees of the retina at the posterior pole. With the new ultra-wide imaging, it is possible to image up to 200 degrees of the retina (covering ~80% of the entire retina).
Peripheral retinal changes can be a non-invasive biomarker for neurological diseases such as Alzheimer's disease, the most common type of dementia. Neuropathological studies show that beta-amyloid and tau plaques accumulate in peripheral regions of the retina. The accumulation of these proteins is thought to be detrimental to the neuronal and microvascular tissues of the retina. How retinal vessels change in the peripheral regions of the retina in vivo in humans remains incompletely understood due to the lack of large-scale human data.
One of the main obstacles to photo analysis in large-scale studies is the lack of fully automatic software to classify the vessels. Aim of this project is develop an algorithm for segmentation of vessels on ultrawidefield images.
Data set
-CIRCAME-EYE study (thousands of images, a new dataset available at the Rothschild Foundation Hospital)
Training period
April 2025 - October 2025, with the possibility of pursuing a PhD after the internship.
En cliquant sur "JE DÉPOSE MON CV", vous acceptez nos CGU et déclarez avoir pris connaissance de la politique de protection des données du site jobijoba.com.