Chercheur post-doctoral en biochimie - biophysique des protéines h/f

Les infections bactériennes sont la deuxième cause de décès dans le monde. Pour réduire cette mortalité, prévention, utilisation optimisée des antibiotiques et vaccination sont des priorités de santé publique mondiale. Le traitement actuel repose donc sur l'utilisation d'antibiotiques, mais leurs effets non-spécifiques, la difficulté d'atteindre les bactéries intracellulaires et l'apparition de résistances en limitent l'efficacité. Parmi les infections bactériennes, la tuberculose, causée par Mycobacterium tuberculosis (Mtb), reste un problème de santé majeur. Un quart de la population est infecté par Mtb de manière latente. De plus, on assiste actuellement à l'apparition de souches ultra-résistantes aux antibiotiques. Il est donc urgent de trouver des solutions alternatives ou complémentaires aux antibiotiques. L'immunothérapie apparait comme une option prometteuse.
Le poste proposé s'inscrit dans un projet financé par la Commission Européenne. Ce projet vise à développer des approches immunothérapeutiques anti-infectieuses innovantes et à réaliser une preuve de concept dans le contexte de la tuberculose.
La personne recrutée aura pour mission de former des complexes entre une protéine de présentation d'antigènes (protéine CD1b) et des antigènes lipidiques isolés de Mtb. Ces complexes seront utilisés par les équipes collaboratrices pour générer des anticorps et/ou des « TCR-like » dirigés contre ces complexes La personne recrutée étudiera ensuite la reconnaissance des complexes CD1b :lipides par ces anticorps ou « TCR-like » et définira les paramètres biophysiques de l'interaction.
Activités
La personne retenue devra mettre au point les conditions de complexation entre la protéine CD1b et différents lipides antigéniques de Mtb. La mise en complexe sera évaluée par focalisation isoélectrique (gels d'IEF) ou électrophorèse capillaire. Les tests de liaison seront effectués par cytométrie en flux et ELISA. Une compréhension approfondie de la thermodynamique de liaison sera obtenue grâce à des expériences de spectroscopie de force à molécule unique (SMFS) basées sur la microscopie à force atomique (AFM). La personne recrutée devra être capable de concevoir et optimiser des protocoles, de maîtriser l'utilisation d'instruments de mesure sensibles, d'analyser les données, les consigner rigoureusement dans un cahier de laboratoire, de présenter ses résultats en réunion de travail aux collaborateurs du consortium européen.
Compétences
Détentrice d'une thèse en biochimie, la personne recrutée aura des connaissances solides dans cette discipline et en biophysique des protéines. Une expertise en AFM ou un intérêt pour cette technique seraient un atout. Elle est rigoureuse, organisée et possède des capacités à travailler de manière autonome, en interaction avec les autres membres de l'équipe. Elle manie avec aisance les techniques de présentation orale et écrite. Il/elle est également enthousiaste avec l'esprit d'équipe.
Contexte de travail


Le travail se déroulera dans l'équipe « Immunomodulation par les lipides et glycoconjugués mycobactériens » dirigée par Jérôme Nigou à l'Institut de Pharmacologie et de biologie structurale (IPBS), CNRS/Université Paul Sabatier (UMR 5089), Toulouse. Notre équipe s'intéresse au décryptage des bases moléculaires et cellulaires de l'infection par Mycobacterium tuberculosis et est impliquée dans différents programmes de lutte contre la tuberculose visant à développer de nouvelles approches diagnostiques, vaccinales ou thérapeutiques. La personne recrutée travaillera dans le cadre d'un projet financé par l'Union européenne, réunissant un consortium de 9 équipes de différents pays. Elle travaillera à l'IPBS sous la direction du Dr M. Gilleron, avec l'aide d'un chercheur de l'équipe pour la mise en place des expériences biophysiques (AFM).