Ingénieur.e en bioinformatique et bioanalyse

Ingénieur.e en Bioinformatique et Bioanalyse

CDI·Ingénieur autre Bac+5 / Master SeqOIA-IT·PARIS (France)

Diagnostic Génomique Cancer Maladies Rares Séquençage


Fiche de poste d'Ingénieur.e en Bioinformatique et Bioanalyse
Groupement de Coopération Sanitaire SeqOIA

Le(La) candidat(e) sera employé.e par l’AP-HP, l’Institut Curie, ou Gustave Roussy pour être mis.e à disposition auprès du GCS SeqOIA.

Le laboratoire SeqOIA (Sequencing, Omics, Information Analysis) est un Groupement de Coopération Sanitaire (GCS SeqOIA), de droit privé associant l’AP-HP, l’Institut Curie et l’Institut Gustave Roussy. Il est l’un des deux laboratoires de biologie médicale sélectionné par le Ministère des Solidarités et de la Santé dans le cadre de l’appel à projet du Plan France Médecine Génomique (PFMG) 2025.

Fonction: Ingénieur en Bioinformatique et Bioanalyse, plateforme SeqOIA-IT
Grade: Cadre de laboratoire
Type de contrat: CDI
Établissement: GCS SeqOIA, Campus Picpus – 6ème étage, 33 bd Picpus, 75012 PARIS

• Liaisons hiérarchiques:
L’administrateur du GCS
Directeur opérationnel du GCS
Directeur SeqOIA-IT
Directeurs adjoints SeqOIA-IT
Responsable de l’équipe Bioanalyse

• Liaisons fonctionnelles:
Les directions fonctionnelles des 3 membres du GCS pertinentes selon les sujets
Les laboratoires de génétique moléculaire du GCS SeqOIA

L’Ingénieur(e) en Bioinformatique et Bioanalyse participe, en collaboration avec les ingénieurs informaticiens et autres bioinformaticiens de la plateforme SeqOIA-IT du GCS SeqOIA, au développement de modules bioinformatiques d’analyse et d’interprétation de données NGS (WGS, WES, RNA-seq) à visée diagnostique, s’intégrant dans le logiciel gLeaves. Il/elle remplit les missions suivantes:

1. Définir des besoins, en lien avec les utilisateurs (Laboratoire, Prescripteurs, CentreQEx) et les équipes internes (développeurs et ingénieurs-intégrateurs);
2. Sélectionner des méthodes existantes d’analyse de données NGS;
3. Concevoir, développer et mener la validation technique de méthodes innovantes d’analyse et d’aide à l’interprétation des données NGS;
4. Assister les utilisateurs du GCS SeqOIA dans la compréhension des méthodes et des résultats d’analyse;
5. Suivre les nouveautés et les méthodes tendances en analyse NGS (veille scientifique).

Formations et/ou qualifications: École d’ingénieur ou formation universitaire équivalente (Master) en biologie, bioinformatique.

Connaissances/ Compétences particulières requises:
• Bonne connaissance en analyses de données de séquençage (WGS, Exome, RNA-seq);
• Bonnes connaissances en programmation (Python, bash, R);
• Excellentes qualités relationnelles et organisationnelles.

Qualités recherchées:
Écoute, communication, bienveillance, esprit d’équipe, curiosité, organisation, sens du détail.
Motivation à travailler pour un projet de grande ampleur.

Télétravail partiel envisageable après période d’essai, et sous condition d’autonomie.
Salaire en fonction de l’expérience.

Les dossiers de candidatures (CV, Lettre de motivation + 1 à 2 références) sont à envoyer par mail à Virginie SAILLOUR (virginie.saillour-ext@aphp.fr), Camille BARETTE (camille.barette@aphp.fr) et Anaïs L’HARIDON (anais.lharidon@aphp.fr) avant le 14 mars 2025.

Offre publiée le 15 février 2025, affichage jusqu'au 14 mars 2025.

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