Mission :
La plateforme de bioinformatique InforBio recherche un.e ingénieur.e pour un CDD de 12 à 18 mois (en fonction de l'expérience). L'ingénieur.e aura à charge le suivi d'un projet sur de petits ARN, en étroite collaboration avec l'équipe Transgenerational Epigenetics & small RNA biology de l'IBPS à Sorbonne Université (https://www.ibps.sorbonne-universite.fr/fr/Recherche/umr-biologie-developpement/epigenetique-transgenerationnelle-biologie-petits-arn) et pourra s'impliquer sur différents projets de la plateforme en fonction de son profil.
Activités :
Les ARN interagissants avec Piwi (Piwi-interacting RNA, piRNA) sont de petits ARN impliqués dans le contrôle des éléments transposables. La plupart de piARNs sont regroupés en clusters sur le génome. Ces clusters sont majoritairement localisés dans des régions riches en répétitions ou encore dans les régions intergéniques. Le projet a pour but d'étudier la formation de ces clusters.
L'ingénieur·e en bioinformatique contribuera activement à :
- L'analyse des données transcriptomiques et génomiques obtenues par séquençage (RNA seq, Oxford Nanopore Technology)
- Le développement et l'optimisation de pipelines bioinformatiques pour l'identification et l'analyse des clusters piRNA.
- L'intégration des données épigénomiques et transcriptomiques pour comprendre les mécanismes d'activation des clusters piRNA.
- La collaboration avec les biologistes pour interpréter les résultats dans un contexte fonctionnel.
Experience: Débutant accepté
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