Au sein de la direction Milieux et impacts sur le vivant, l’unité Toxicologie expérimentale et modélisation (TEAM), composée d’une vingtaine de personnes, est dédiée à la modélisation biomathématique appliquée à la toxicologie et à l’écotoxicologie. Les approches in silico développées ont pour objectif de caractériser la toxicité et l’écotoxicité des substances chimiques. Sous la responsabilité d’un ingénieur de cette unité, vous contribuerez à étudier les impacts des polluants sur le système immunitaire.
Le premier objectif de cette alternance consistera à construire un chemin de l’effet néfaste quantitatif (Adverse Outcome Pathway, AOP, ) sur l’immunité innée, principalement des poissons, en se focalisant sur l’activité phagocytaire et la flambée oxydative (Key event, KE).
Le second objectif sera de relier quantitativement les premières étapes de l’AOP en s’appuyant sur les travaux d’intégration des biomarqueurs dans un cadre mathématique quantitatif mécaniste (par exemple, modèle de gestion de l’énergie par les organismes «dynamic energy budget», DEB) et/ou statistique (modèle de régression non linéaire). Les biomarqueurs seront utilisés dans ce cadre en tant que points de mesure externe (i.e., «readout») mesurant les évènements importants dans la cascade des effets toxiques non directement observables.
Dans ce cadre, vous serez notamment chargé(e) de:
- Finaliser l’exploration de l’existant sur AOPwiki et dans la bibliographie: synthèse bibliographique sur différentes espèces, identification d’un ou plusieurs stresseurschimiques types (substances spécifiques du MIE);
- Investiguer les outils IA les plus pertinents, notamment AOP-help Finder, qui est un outil IA de revue de la littérature destiné à recueillir les informations sur des évènements clés menant à un AO pour une liste de substances. Vous pourrez ainsi:
o Acquérir la capacité à utiliser cet outil à l’Ineris
o Qualifier cet outil – déterminer son niveau de validité
o L’utiliser ou l’adapter pour les réseaux d’AOP immunotoxicité
- Proposer un plan expérimental détaillé pour quantifier les évènements clés aux différents niveaux de l’AOP;
- Planifier et/ou réaliser des expériences pour produire des données sur culture primaire avec développement de dosage pour confirmer certain key event de l’AOP;
- Intégrer les premières étapes de l’AOP dans un cadre mathématique quantitatifmécaniste et/ou statistique (Modélisation DEB TK-TD ou modèle de régression non linéaire).
Etudiant(e), vous souhaitez poursuivre vos études en Bac +5 dans le domaine de la biologie cellulaire, de la toxicologie, des mathématiques appliquées à la toxicologie par la voie de l’alternance.
Vous avez des connaissances en:
- Biologie cellulaire, toxicologie, pharmacodynamie;
- Modélisation mathématique ou bioinformatique;
- Langages de programmation et Machine learning / IA;
- Anglais scientifique.
Les qualités suivantes seront un plus:
- Grande rigueur;
- Excellente capacité rédactionnelle, d’analyse et de synthèse;
- Goût pour le travail en équipe;
- Sens du service et excellente qualité relationnelle.
L’Ineris (Institut national de l'environnement industriel et des risques) est un Établissement Public à caractère Industriel et Commercial (EPIC) et placé sous la tutelle du ministère chargé de l'environnement. Son effectif est de 580 collaborateurs environ dont les 2/3 sont des ingénieurs/docteurs, pour l’essentiel basés à Verneuil-en-Halatte (Oise). Le chiffre d’affaires est de 80M€. Le statut du personnel est de droit privé (convention collective de la chimie). Sa mission : Réaliser ou faire réaliser des études et des recherches permettant de prévenir les risques que les activités économiques font peser sur la santé, la sécurité des personnes et des biens ainsi que sur l’environnement. Travailler à l’Ineris, c’est l’opportunité de mettre en œuvre et développer ses compétences dans le cadre des missions de recherche et d’expertise pour le compte des pouvoirs publics et des industriels. Ces missions intègrent excellence scientifique et technique, maîtrise de la gestion des coûts et des délais, et activités de laboratoire ou de terrain. L’Ineris dispose de moyens d’essais de pointe, souvent uniques en France voire en Europe.
Nos atouts :
A Verneuil en Halatte (site principal) : Environnement de travail privilégié sur un site boisé de 40 ha accessible en transports en commun, à 40mn au nord de Paris.
Une navette “Ineris” au départ de la gare de Creil assure gratuitement le trajet jusqu’à notre site en 10 minutes.
L’Ineris dispose de 30 000 m2 de laboratoires et halles d'essais avec des équipements multiples et à la pointe de la technologie.
Parking clos et surveillé
Restauration subventionnée (ou ticket restaurant pour sites hors Verneuil)
Transports publics remboursés partiellement
Bornes de recharge pour véhicules électriques
Possibilité de télétravail (selon le type de poste occupé)
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