Post-doctorant contractuel en mécanismes moléculaires f/h

Contexte

Une augmentation de l’adiposité médullaire est démontrée dans différents types d’ostéoporose, notamment post-ménopausique ou liée au vieillissement, cortico-induite (revue : Hardouin P et al, 2016) et même liée à l’anorexie mentale (Legroux-Gérot I et al, 2018 ; Bredella MA et al, 2009). En effet, l’anorexie mentale représente une situation ostéoporotique unique, notamment au regard de son contexte non inflammatoire et métabolique, de la grande précocité de sa survenue et du faible nombre d’études qui lui sont consacrées. Ses multiples conséquences incluent des perturbations neuro-endocriennes majeures et une densité minérale osseuse (DMO) basse associée à un taux de fracture de 44% chez les patientes ainsi qu’à une adiposité médullaire augmentée qui est fortement soupçonnée de participer aux altérations osseuses observées. Cette fragilité osseuse n’est souvent que partiellement corrigée par la reprise de poids et la sortie d’aménorrhée, ce qui entraine un risque de fracture osseuse élevé tout au long de la vie.

Notre équipe a développé un modèle murin mimant les conséquences physiologiques de l’anorexie mentale (modèle SBA : Separation-Based Anorexia) afin d’étudier le rôle de l’adipocyte de la moelle osseuse dans le développement de l’ostéoporose liée à l’anorexie mentale (Zgheib et al, 2014). L’hypothèse de l’implication des adipocytes médullaires est soutenue par le fait que les ostéoblastes et les adipocytes médullaires proviennent d’un progéniteur commun, la cellule souche squelettique (anciennement cellule souche mésenchymateuse), qui fait partie des cellules stromales, et l’existence d’une relation inverse entre ostéogenèse et adipogenèse soutenue par de nombreuses études. Parmi les voies qui régulent la différenciation ostéoblastique, il a été montré, que la sirtuine de type 1 (Sirt1 - histone désacétylase) présente un effet pro-ostéogénique et un effet anti-adipogénique (Shakibaei M et al, 2012).

Par ailleurs, dans notre modèle murin mimant l’anorexie mentale, nous avons montré une diminution durable de l’expression de Sirt1 dans les cellules souches stromales de la moelle osseuse des souris SBA par rapport aux mêmes cellules des souris contrôles (CT). En effet, après 48h de culture (milieu de prolifération standard) ou après 14 jours de co-différenciation, les cellules souches stromales des souris SBA présentent un niveau d’ARNm de Sirt1 inférieur de 80% à celui des cellules souches des souris CT. Ceci s’accompagne d’une part, d’une accélération et d’une augmentation de l’adipogenèse au détriment de l’ostéogenèse et d’autre part, d’une forte acétylation des facteurs de transcriptions Runx2 et Foxo1. L’ensemble de ces résultats a été publié en 2020 par le Dr. Louvet dans la revue Bone (Louvet L et al, 2020) grâce à financement post-doctoral de l’ULCO en 2017.


Activités principales

L’exploitation des données recueillies (RNA-Seq et mi-RNA) représente une étape indispensable pour le projet. L’objectif est de développer des outils permettant de rapprocher dans une stratégie intégrative les données issues de ces deux approches pour en extraire des hypothèses quant aux mécanismes moléculaires impliqués, hypothèses qui seront ensuite évaluées biologiquement par des tests fonctionnels menés in vitro.

Diplôme exigé : Doctorat en bio-informatique

Compétences*

Connaissance, savoir :

Une bonne connaissance pour maîtriser tous les outils informatiques

Savoir-faire :

Maîtriser les outils de bio-informatique utilisés dans le traitement des données issues d’une analyse transcriptomique (RNA-Seq) et des mi-RNA

Savoir être :

· Motivé-e

· Autonome

· Rigoureux-se

· Organisé-e

· Une bonne capacité de communication


L'Université du Littoral- Côte d'Opale (ULCO), établissement pluridisciplinaire et multipolaire, propose à ses 10 000 étudiants une centaine de diplômes habilités dans 4 domaines de formation : les Arts, Lettres et Langues ; le Droit, Economie, Gestion ; les Sciences Humaines et Sociales ; les Sciences, Technologies, Santé/STAPS. L’ULCO comprend 12 départements pédagogiques, 1 IUT, 1 école de commerce, 1 école d’ingénieurs, 14 unités de recherche et des services généraux et communs.


La préoccupation majeure de l'ULCO est d’œuvrer à la réussite académique et professionnelle de ses étudiants. La proximité avec les équipes pédagogiques, un accompagnement personnalisé, un enseignement de qualité et des méthodes éducatives innovantes créent un cadre propice à l'acquisition des connaissances, au dialogue et à la réussite de chacun.


Le soutien et le développement de la recherche ont toujours été une priorité pour l'université qui en tire une visibilité au niveau national et international. Elle s'articule autour de trois axes : « Mer et littoral, transformations et enjeux» ; « Mutations technologiques et environnementales» ; « Humanités et territoires intégrés ».

Elle est dotée d’un budget de 100 M€, dont 75 M€ de masse salariale.
Elle dispose de 520 emplois de personnels enseignants-chercheurs et enseignants et de 500 emplois de BIATSS.
Son patrimoine immobilier compte plus de 112 000 m².