Ingénieur bio-informatique opérations

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Bio-informatique NGS


Annonce Ingénieur Bio-informatique Opérations

PathoQuest est une société spécialisée de prestation de service (CRO), spin off de l’Institut Pasteur, qui propose des solutions innovantes pour le Contrôle Qualité des produits pharmaceutiques d’origine biologique. PathoQuest propose aux Biotech innovantes du monde entier un service expert complet de la réception des échantillons à la production des certificats d’analyse. Ses tests utilisent des protocoles propriétaires de traitement des échantillons, une plateforme de séquençage NGS (Next Generation Sequencing) et des pipelines d’analyses bio-informatiques spécialisés. Actuellement en phase de scale-up, nous comptons une cinquantaine de collaborateurs en France et aux Etats-Unis.

Nous recherchons actuellement un Ingénieur Bio-informatique h/f au sein de notre département Opérations.


Votre mission

1. Au sein du département Opérations, sous la responsabilité du Responsable Pole BFX opérations et avec le support scientifique et technique du Head of Bioinformatics, vous assurez le suivi, l’exécution et le rendu dans les délais des analyses bio-informatiques des données produites par les plates-formes de séquençage de la société, principalement celles qui concernent les prestations de sécurité virale et de caractérisation génétique ainsi que les études client à façon («custom»).
2. Participer aux activités de production de l’entreprise et à leurs évolutions.
3. Réaliser les analyses clients internes et externes (incluant les analyses complémentaires et les analyses à façon).
4. Participer au nettoyage des données présentes sur les serveurs.
5. Participer à la formation du personnel sur les pipelines maîtrisés et au maintien des supports de formation.
6. Participer à l’optimisation des pipelines et outils bio-informatiques et permettre leur transfert en GMP.
7. Suivre la démarche qualité de l’entreprise lors des phases de conception, de développement et de déploiement des produits logiciels (bio)informatiques, notamment en rédigeant les documents associés (spécifications fonctionnelles, cahier de tests).
8. Participer à la rédaction de procédures et modes opératoires relatifs à l’activité Bio-informatique.
9. Participer à la réalisation d’analyses dans le cadre de la validation de nouvelles méthodes.
10. Assurer une veille technologique efficace en (bio)informatique.
11. Participer à l’assurance qualité des produits selon le référentiel des Bonnes pratiques de Fabrication (BPF).


Profil recherché

De formation en bio-informatique, vous avez une expérience sur une fonction similaire sur Illumina ou Nanopore.

Vous maîtrisez les langages de développement bio-informatique tels que Python et R.

Vous êtes à l’aise de travailler dans un environnement Linux et sur des serveurs de calcul haute performance.

Vous savez analyser des données de séquençage haut-débit et en interpréter les résultats.

Compétences techniques: Assemblage De Novo & Guidé, Mapping, Linux, NCBI, NGS, Blast, Variant calling.

Connaissance en biologie (biologie moléculaire et cellulaire, génomique et génétique).

Connaissance des normes qualité de type BPF.

Un bon niveau d’anglais est un plus.

Capacité à travailler en équipe et à l’interface entre plusieurs disciplines.

Excellente rigueur dans le suivi des processus.

Curiosité et intérêt pour des domaines en forte évolution.

Qualités relationnelles et faculté d’adaptation.

Autonomie et sens de l’initiative.


Localisation

Ce poste est basé près du bureau de Paris (13e arrondissement) en France.


Rémunération

En fonction de l’expérience du candidat.


Les avantages du projet

Environnement en pleine croissance, scale-up dynamique, innovante et ambitieuse.

Une entreprise à la pointe de la génétique, de la bio-informatique et de la biologie moléculaire.

Portefeuille de clients attrayant et d’envergure mondiale.

Nous remercions les personnes intéressées par ce poste et qui répondent aux critères ci-dessus de nous faire parvenir leur curriculum vitae à l’adresse .

Offre publiée le 5 mars 2025, affichage jusqu'au 4 mai 2025.

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