Mission :
Analyse bioinformatique de données transcriptomique (bulk et single-cell RNAseq) dans le cadre de projets étudiant la réponse de l'épithélium des voies respiratoires à des agents cancérigènes. Analyses « long-reads » sont également, envisagées.
Mise en œuvre et amélioration de pipelines d'analyse déjà existants dans l'équipe. Si nécessaire, développement de nouveaux pipelines.
Veille technologique afin d'évaluer de nouveaux pipelines.
Exploration et exploitation des données dans le but d'écrire des articles scientifiques.
Gestion des interactions avec les partenaires du projet (biologie des systèmes, intelligence artificielle).
Activités :
Choisir et adapter les pipelines d'analyse transcriptomiques sur cellule unique et en « bulk RNAseq » aux questions biologiques posées par l'équipe de recherche
Analyser les résultats provenant des chercheurs de l'équipe et les replacer dans le contexte des résultats obtenus par d'autres équipes
Gérer les projets conjointement avec les chercheurs et doctorants de l'équipe.
Rédiger des rapports d'expérience.
Participer à la veille scientifique et technologique sur les analyses de données transcriptomique.
Experience: Débutant accepté
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