Ingénieur(e) en ia pour la microscopie (h/f)

Ingénieur(e) en IA pour la microscopie (H/F)

Entreprise/Labo : Institut Curie / Orsay

Description :

Laboratoire - Service

Le Multimodal Imaging Center - MIC - ( https://curie.fr/plateforme/curiecoretech-centre-dimagerie-multimodale-uar2016-us43 ) regroupe des expertises en microscopies photonique, électronique et ionique, ainsi qu’en traitement et analyse d’images. L'unité met à disposition de la communauté scientifique, académique et industrielle une offre de service, de formation et de R&D en imagerie multimodale.
Le pôle de traitement et analyse d’images est spécialisé dans la création de « pipelines » à façon pour l’analyse d’images provenant de toute modalité d’imagerie. Il a notamment créé plusieurs plugins pour Fiji/ImageJ comme TomoJ pour la reconstruction tomographique et MIC-MAQ pour la segmentation de noyaux/cellules et leur métrologie.

Missions

L’objectif est de créer des modèles d’intelligence artificielle (IA) permettant la segmentation et la classification d’objets biologiques dans des images de microscopies électroniques, dans le cadre d’une prestation de service auprès d’une entreprise pharmaceutique.
Pour cela, la personne recrutée devra :

* Curer les datasets fournis par l’industriel
* Améliorer et/ou développer des algorithmes de détection d’objets biologiques subcellulaires isolés
* Améliorer et/ou développer des algorithmes de classification d’objets biologiques subcellulaires isolés
* Intégrer les développements au sein des « pipelines » d’analyse de l’industriel (notamment sous Fiji)
* Entretenir une veille active sur les avancées en segmentation automatisée par IA
* Collaborer étroitement avec l’équipe « analyse des données et traitement d'images » de l'industriel pour assurer la réalisation des prestations de service.

Le/La candidat(e) sera supervisé(e) par l’ingénieur responsable du service de traitement et analyse d’images du MIC. Il/elle bénéficiera aussi d’échanges réguliers avec l’industriel et d’échanges quotidiens avec des étudiants et des ingénieurs de l’équipe.

De plus, le/la candidat(e) aura l'opportunité d'interagir avec la communauté des analystes d’image de l'Institut à travers le réseau des plateformes de microscopie de l’Institut Curie.


Contact : Cédric MESSAOUDI, Frédéric COQUELLE #J-18808-Ljbffr