Ingénieur.e de Recherche Bioinformaticien.ne
CDD·IR·12 mois (renouvelable) Bac+8 / Doctorat, Grandes Écoles
Institut Hospitalo-Universitaire HealthAge (CHU de Toulouse) · TOULOUSE (France)
Date de prise de poste : 1 novembre 2024
Structure d’accueil.
Unité de Soutien Méthodologique à la Recherche (USMR) (Methodological Research Support Unit)
Centre Hospitalier Universitaire (CHU) de Toulouse (Toulouse University Hospital)
Fondé et présidé par le Pr. Bruno VELLAS, l’Institut Hospitalo-Universitaire HealthAge est le seul IHU en France exclusivement dédié au vieillissement. L’IHU HealthAge a pour ambition de renforcer l’excellence du site toulousain comme centre de référence en Europe et dans le monde en Géroscience.
Description du poste.
L’ingénieur.e de Recherche Bioinformaticien.ne recruté.e participera à la compréhension des mécanismes biologiques du vieillissement via l’identification de biomarqueurs moléculaires permettant de détecter et de manipuler les décompensations biologiques à un stade précoce.
Activités principales.
* Analyser des données biologiques massives dans les domaines des sciences omiques (génomique, épigénomique, métabolomique, transcriptomique, protéomique, etc.)
* Appliquer des techniques avancées de machine learning et deep learning
* Programmer et développer des algorithmes d’analyse de données et de simulation
* Formuler des modèles mathématiques pour interpréter des mesures biologiques et fournir des prédictions
* Connaissances avancées des approches de bio-informatique pour l’analyse de données
* Expérience significative en data science/analysis, en particulier traitement de données omiques multi-espèces
* Expérience significative en machine learning et deep learning (Support Vector Machine, Random Forest, Convolutional Neural Networks, etc.)
* Connaissances des différents langages de programmation (R, Python, SQL…)
* Maîtrise des outils de gestion de versions des codes source (git, GitLab)
* Connaissance des gestionnaires de workflow courants en bio-informatique (nextflow en priorité)
* Maîtrise des environnements Linux
* Expérience avec Slurm pour la gestion de clusters de calcul haute performance (HPC) appréciée
* Bonne connaissance des biostatistiques
* Connaissances générales en biologie cellulaire et moléculaire
* Expérience ou intérêt marqué pour la biologie computationnelle appliquée à la Géroscience
* Anglais niveau C1
Niveau de diplôme et formation(s). Bac + 8 (éventuellement Bac +5 a minima). Master 2, diplôme d’ingénieur ou PhD en bio-informatique, biologie computationnelle ou équivalent. En l’absence de PhD, 1 à 2 ans d’expérience post-master en lien avec les activités.
Informations générales.
Date de prise de fonction. Octobre (Novembre) 2024
Durée. 12 mois renouvelables
Temps de travail. Temps plein
Activités télétravaillables. Oui 2 jours par semaine
Modalités de candidature.
Contact. Dr. Laure ROUCH, Maître de Conférences des Universités - Praticien Hospitalier (MCU-PH)
Envoyer CV, lettre de motivation et 2 lettres de recommandation à rouch.l@chu-toulouse.fr
Offre publiée le 15 septembre 2024, affichage jusqu'au 15 octobre 2024
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