Basé sur notre savoir-faire, des méthodes de biophysique computationnelle (Modélisation moléculaire) et des méthodes d’apprentissage machine seront déployées pour découvrir les propriétés structurales et caractériser la cinétique de canaux ioniques voltage dépendants sauvages et mutés
Activités
Taches Principales :
- Modélisation moléculaire et méthodes d’échantillonnage amélioré
- Développement et utilisation de techniques d’apprentissage machine pour générer des conformations moléculaires
Analyse des données (réduction de dimensionnalité / modèles d’états de Markov / Cinétiques)
- Calculs sur les supercalculateurs nationaux et européens
- Rédactions d’articles scientifiques
Taches secondaires :
- Mentoring de stagiaires (M2)
Compétences
- Connaissance de base en biologie des canaux ioniques au niveau moléculaire.
- Connaissances avancées en dynamique moléculaire.
- Maitrise des techniques d’apprentissage machine (supervisés et non supervisés)
- Maitrise des programmes de modélisation Gromacs et OpenMM
- Capacité à planifier et à réaliser des recherches.
- Compétences en programmation Python ( avancé).
- Maitrise du calcul HPC.
Contexte de travail
Le Laboratoire de Physique et Chimie Théoriques (LPCT) est une unité mixte de recherche entre le CNRS et l’Université de Lorraine (UMR 7019) qui regroupe des théoriciens de la matière condensée, de la physique statistique, de la chimie quantique et de la bio-physique/chimie (34 permanents et une quarantaine de Doctorants et Post-docs).
Le Laboratoire de Physique et Chimie Théoriques (LPCT) est une unité mixte de recherche entre le CNRS et l’Université de Lorraine (UMR 7019) qui regroupe des théoriciens de la matière condensée, de la physique statistique, de la chimie quantique et de la bio-physique/chimie (34 permanents et une quarantaine de Doctorants et Post-docs).
Contraintes et risques
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