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post-doctorant ou post-doctorante en (bio)chimie théorique (H/F)
Cette offre est disponible dans les langues suivantes :
Date Limite Candidature : mardi 29 avril 2025 23:59:00 heure de Paris
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Informations générales
Intitulé de l'offre : post-doctorant ou post-doctorante en (bio)chimie théorique (H/F)
Référence : UPR9080-ELIDUB-005
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : PARIS 05
Date de publication : mardi 8 avril 2025
Type de contrat : Chercheur en contrat CDD
Durée du contrat : 12 mois
Date d'embauche prévue : 1 octobre 2025
Quotité de travail : Complet
Rémunération : 3000 € bruts mensuel
Niveau d'études souhaité : Doctorat
Expérience souhaitée : Indifférent
Section(s) CN : 13 - Chimie physique, théorique et analytique
Missions
Le projet de recherche dans lequel s'inscrit ce post-doctorat a pour but de caractériser à l'échelle moléculaire l'origine d'effets d'ions spécifiques dans la catalyse par un ribozyme (enzyme à ARN). Le projet s'appuiera sur des méthodes et protocoles développés ces dernières années dans l'équipe pour explorer de façon dynamique (DFTB3/MM-MD) le chemin réactionnel en présence de différents ions, qui sera raffiné à l'aide de méthodologies récentes de type ML/MM-MD. En parallèle, le chercheur sera associé dans la paramétrisation et l'évaluation d'un nouveau champ de force Amber-OL15-ECC pour la description des interactions ions-acides nucléiques.
Activités
1. simulations de dynamique QM/MM
2. entrainement et évaluation d'une méthodologie ML/MM-MD
3. simulations de dynamique moléculaire, calculs alchimiques d'énergie libre
4. machine learning potentials
5. analyse détaillée des simulations (écriture de scripts)
6. rédaction indépendante d'articles scientifiques
7. présentation des résultats en anglais
Compétences
1. thèse en chimie théorique ou biophysique
2. expérience en dynamique moléculaire pour des systèmes complexes (biologiques)
3. expérience souhaitée dans certains des champs suivants: échantillonnage avancé / calculs alchimiques, QM/MM, modélisation de l'ARN, Neural Network Potentials
4. programmation pour l'analyse de simulations
5. maitrise de l'anglais (C1). Connaissance du français non nécessaire.
Contexte de travail
Le Laboratoire de Biochimie Théorique (11 chercheurs permanents, une trentaine de membres au total) est situé au coeur de Paris, dans un environnement très stimulant scientifiquement. Nous sommes spécialisés dans la modélisation, à différentes échelles, de systèmes biologiques. Ce projet est soutenu par un financement ANR.
#J-18808-Ljbffr
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