Ingénieur·e analyses de données et développement en bioinformatique h/f

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Présentation INRAE

L'Institut national de recherche pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l'animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes. Environnement de travail, missions et activités

Vous serez accueilli-e au sein de de l'équipe DEBI de l'UMR IGEPP. Vous serez plus particulièrement basé sur le site du centre IRISA/Inria de Rennes, au sein de la plateforme de bioinformatique GenOuest, sur le campus de Beaulieu à Rennes. Ce travail s'inscrit dans le projet européen ELIXIR-STEERS, qui vise à promouvoir les bonnes pratiques de gestion des logiciels d'analyse en bioinformatique, et à supporter les communautés scientifiques dans l'adoption de ces bonnes pratiques.

Vous serez plus particulièrement en charge de :
- Contribuer à la définition, à la mise en place, et à la promotion de standards et de bonnes pratiques pour le développement de logiciels de bioinformatique, en collaborations avec les autres partenaires du projet
- Appliquer et promouvoir ces bonnes pratiques sur des cas d'usages pratiques (assemblage et annotation de génomes par exemple) issus du domaine de l'analyse de données de biodiversité, en particulier sur les projets de séquençage de génomes à grande échelle (dont le projet ATLASea)
- Participer à des groupes de travail au niveau national et international sur ces thématiques

Travail localisé au sein de la plateforme de bioinformatique GenOuest, dans les locaux du centre IRISA/Inria de Rennes.

Formations et compétences recherchées

Master/Ingénieur (Bac +5)
- Formation recommandée : Niveau 7 - (Bac +5 et plus)
- Connaissances souhaitées : Analyse de données génomiques, base en développement logiciel (Python), systèmes de workflows en bioinformatique (Galaxy, Nextflow, Snakemake)
- Expérience appréciée : Expérience en analyse de données et en développement de workflows.
- Aptitudes recherchées : Autonomie, Initiative, Sens de l'organisation, Langue anglaise niveau B2 à C1, Travail en équipe et à distance, Capacité d'écoute et sens du contact.

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :
- Jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- D'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- De dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- D'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- De prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- D'activités sportives et culturelles ;
- D'une restauration collective.

Modalités pour postuler

J'envoie mon CV et ma lettre de motivation

Les personnes accueillies à INRAE, établissement public de recherche, sont soumises aux dispositions du Code de la fonction publique notamment en ce qui concerne l'obligation de neutralité et le respect du principe de laïcité. A ce titre, dans l'exercice de leurs fonctions, qu'elles soient ou non au contact du public, elles ne doivent pas manifester leurs convictions, par leur comportement ou leur tenue, qu'elles soient religieuses, philosophiques ou politiques. > En savoir plus : site fonction publique.gouv.fr