Ingénieur(e) en ia pour la microscopie f/h - système, réseaux, données (h/f)

Descriptif du poste:

Laboratoire - Service
Le Multimodal Imaging Center - MIC - (https://curie.fr/plateforme/curiecoretech-centre-dimagerie-multimodale-uar2016-us43) regroupe des expertises en microscopies photonique, électronique et ionique, ainsi qu'en traitement et analyse d'images. L'unité met à disposition de la communauté scientifique, académique et industrielle une offre de service, de formation et de R&D en imagerie multimodale.
Le pôle de traitement et analyse d'images est spécialisé dans la création de « pipelines » à façon pour l'analyse d'images provenant de toute modalité d'imagerie. Il a notamment créé plusieurs plugins pour Fiji/ImageJ comme TomoJ pour la reconstruction tomographique et MIC-MAQ pour la segmentation de noyaux/cellules et leur métrologie.

Missions
L'objectif est de créer des modèles d'intelligence artificielle (IA) permettant la segmentation et la classification d'objets biologiques dans des images de microscopies électroniques, dans le cadre d'une prestation de service auprès d'une entreprise pharmaceutique.
Pour cela, la personne recrutée devra :
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Curer les datasets fournis par l'industriel
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Améliorer et/ou développer des algorithmes de détection d'objets biologiques subcellulaires isolés
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Améliorer et/ou développer des algorithmes de classification d'objets biologiques subcellulaires isolés
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Intégrer les développements au sein des « pipelines » d'analyse de l'industriel (notamment sous Fiji)
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Entretenir une veille active sur les avancées en segmentation automatisée par IA
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Collaborer étroitement avec l'équipe « analyse des données et traitement d'images » de l'industriel pour assurer la réalisation des prestations de service.

Le/La candidat(e) sera supervisé(e) par l'ingénieur responsable du service de traitement et analyse d'images du MIC. Il/elle bénéficiera aussi d'échanges réguliers avec l'industriel et d'échanges quotidiens avec des étudiants et des ingénieurs de l'équipe.
De plus, le/la candidat(e) aura l'opportunité d'interagir avec la communauté des analystes d'image de l'Institut à travers le réseau des plateformes de microscopie de l'Institut Curie.

Profil recherché:

Formation et expérience
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Le/La candidat(e) doit être titulaire d'un diplôme d'ingénieur et/ou d'un doctorat en (bio)informatique avec une spécialisation en IA.
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Expériences professionnelles souhaitées.

Compétences et qualités requises
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Solide expérience en IA pour le traitement et analyse d'image et/ou la vision par ordinateur.
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Solide expérience en programmation Python.
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Expérience de travail sur un cluster de calcul serait un plus.
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Expérience de programmation Java serait un plus.
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Connaissances en biologie structurale et cellulaire seraient un plus.
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L'équipe étant internationale, une aisance en anglais écrit et oral est nécessaire.
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Le projet implique du management transverse, nécessitant une autonomie dans la priorisation des sujets et l'organisation du temps.
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Gestion dynamique de projet.
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Capacité de transmission de connaissances.
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Possibilité de déplacements en France.

Toutes nos opportunités sont ouvertes à des personnes en situation de handicap.

Informations sur le contrat
Type de contrat: CDD
Date de démarrage: dès que possible
Durée du contrat: 12 mois
Temps de travail: Temps complet
Rémunération: selon les grilles en vigueur
Avantages: Restauration collective, prise en charge du titre de transport annuel à 70%, mutuelle d'entreprise
Localisation du poste: Orsay (91)

Pour postuler, merci d'envoyer CV et lettre de motivation.

L'Institut Curie est un employeur inclusif respectant l'égalité des chances.
Il s'engage également à appliquer des normes exigeantes en matière d'intégrité de la recherche.
https://euraxess.ec.europa.eu/sites/default/files/brochures/eur_21620_en-fr.pdf

Experience: Débutant accepté

Qualification: Cadre

Secteur d'activité: Recherche-développement en autres sciences physiques et naturelles

L'Institut Curie est un acteur majeur de la recherche et de la lutte contre le cancer. Il est constitué d'un hôpital et d'un Centre de recherche de plus de 1000 collaborateurs avec une forte représentativité internationale.
L'objectif du Centre de recherche de l'institut Curie est de développer la recherche fondamentale et d'utiliser les connaissances produites pour améliorer le diagnostic, le pronostic, la thérapeutique des cancers dans le cadre du continuum entre la recherche fon...