CDD·IE·12 mois (renouvelable) Bac+5 / Master CRCT, équipe 13 Oncogénomique et immunologie du myélome · Toulouse (France)
Date de prise de poste : 3 février 2025
Résumé du poste:
Au sein de l’équipe 13 du CRCT, spécialisée en immunologie du myélome multiple, vous participerez à des projets de recherche en bioinformatique, avec un focus sur l'analyse de données NGS. Vous serez amené.e à collaborer avec des chercheurs et techniciens pour traiter, analyser, et interpréter des données issues de diverses technologies de séquençage. Ce poste vous permettra de contribuer à la recherche de pointe dans le domaine de l'oncologie.
Missions principales:
1. Traitement et analyse de données NGS pour des projets de recherche en scRNAseq, scATACseq, RNAseq, etc.
2. Réalisation des étapes de démultiplexage, alignement, contrôle qualité et analyse de données, en lien direct avec les questions de recherche.
3. Interprétation des résultats en concertation avec les chercheurs.
4. Rédaction de la documentation pour les pipelines et analyses.
5. Organisation et gestion informatique des échantillons biologiques en lien avec les besoins de biobanking.
6. Conception d’expérimentations en coordination avec les équipes de recherche.
7. Création, optimisation et automatisation de pipelines bioinformatiques pour améliorer les flux de travail et assurer la reproductibilité des analyses.
Profil recherché:
* Formation: Bac+5/Master en bioinformatique
* Compétences techniques:
o Maîtrise de langages de programmation (R, Bash, optionnellement Python).
o Connaissance en scRNAseq, scATACseq, RNAseq, ...
o Connaissance d’outils bioinformatiques tel que CellRanger, Bioconductor, dplyr, Seurat, ggplot2, ComplexHeatmap, ...
o Utilisation d’un cluster de calcul (Genotoul)
o Anglais écrit a minima
o Des connaissances en immunologie seraient un plus
o Connaissances en mathématiques et statistiques appréciées
* Compétences humaines: Rigueur, gestion de projets, autonomie, bonne communication, organisation et capacité à travailler en équipe.
Environnement de travail: Au sein d’une équipe multidisciplinaire et dynamique, impliquée dans des projets innovants en oncologie.
Rémunération: Selon l’expérience et la grille salariale de l’Inserm/CHU.
Procédure: Envoyer votre candidature par mail à Ludovic MARTINET et Claire DELAMARE-DEBOUTTEVILLE : ludovic.martinet@inserm.fr, claire.delamare-deboutteville@inserm.fr
Date limite: 14 janvier 2025
Ludovic MARTINET et Claire DELAMARE-DEBOUTTEVILLE
Offre publiée le 14 novembre 2024, affichage jusqu'au 14 janvier 2025
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