Le centre de neuroinformatique de l’ICM recrute un ingénieur HPC junior ) pour l’administration de systèmes informatiques dédiés aux applications scientifiques et l’ordonnancement des jobs associés.
Le centre a pour but d’améliorer la collecte, le stockage, la gestion et l’analyse des données scientifiques et médicales générées par les équipes de recherche et les plateformes technologiques de l’Institut. Ces données structurées (mesures, images, signaux, données de séquençages) ou non-structurées (texte) renseignent sur le fonctionnement et l’anatomie du système nerveux normal ou pathologique à différentes échelles spatiales et temporelles. Leur exploitation conduit à une meilleure compréhension du cerveau humain, au développement de nouvelles stratégies thérapeutiques et la mise au point d’outils d’aide à la décision. Le centre de neuroinformatique met en place une infrastructure informatique dédiée pour ces « big data » et à leur exploitation par des outils de calcul scientifique et d’apprentissage statistique. Il fournit un soutien au développement méthodologique, et coordonne les activités des chercheurs, ingénieurs et techniciens dans ce domaine.
L’ingénieur HPC exercera ses fonctions au sein de la direction des systèmes d’information de l'ICM, et rapportera auprès du coordinateur du centre. Il/elle aura pour mission de d’assurer le bon déroulement des travaux lancés par les chercheurs et la maintenance de l’architecture matérielle et logicielle requise pour les activités technologiques et scientifiques des équipes de l’Institut.
Activités principales :
* Participer à l’administration des serveurs scientifiques (grappes de calcul, stockage haute performance)
* Assurer le soutien informatique aux équipes scientifiques pour l’établissement et l’amélioration de jobs de calcul
* Permettre la reproductibilité des applications via la mise en œuvre de docker
* Analyser, comprendre et optimiser les jobs de calcul
Activités secondaires :
* Assurer un soutien informatique aux équipes et plates-formes du site pour le développement d’outils nécessaires à leurs activités et la valorisation, par leur optimisation et leur déploiement, des applications créées en interne sur la grappe de calcul
* Former, conseiller et assister les utilisateurs à l’utilisation d’infrastructures informatiques scientifique
* Assurer une veille technologique informatique sur les matériels et les outils logiciels utilisés sur la grappe de calcul
Savoir
* Titulaire d’un diplôme Bac + 3/4
* Pratique avancée d’environnements UNIX/Linux
* Compétences en architecture des systèmes informatiques et des architectures parallèles, expertise des outils d’administration et de monitoring, utilisation de machines virtuelles et docker
* Maîtrise d’un ou plusieurs langages de programmation serait un plus (exemple : C, Python, Java, R, Matlab, ..)
* Connaissances des techniques d’optimisation et de distribution de calculs (MPI, OpenMP, ..)
* Connaissance des ordonnanceurs de grappe de calcul (Slurm, Torque, LSF, PBS, …)
* Compétences des algorithmes et programmation distribuée seraient un plus
* Vous avez une connaissance opérationnelle Linux et vous êtes enfin à même de concevoir, installer et exploiter une infrastructure Linux et de rédiger des procédures d’exploitation.
* Capacités rédactionnelles (notes techniques, formations)
* Maîtrise de l'anglais technique (lu, écrit, parlé)
Savoir-être
* Vous aimez le travail en équipe et en environnement multidisciplinaires
* Vous avez un sens du relationnel très développé
* Sens du service aux utilisateurs
* Autonomie et esprit d’initiative
* Rigueur méthodologique et organisationnelle
L’Institut du Cerveau est une Fondation privée reconnue d’utilité publique dont l’objet est la recherche fondamentale et clinique sur le système nerveux.
Sur un même lieu, 850 chercheurs, ingénieurs et médecins couvrent l’ensemble des disciplines de la neurologie, dans le but d’accélérer les découvertes sur le fonctionnement du cerveau et les développements de traitements sur les maladies comme : Alzheimer, Parkinson, Sclérose en plaques, épilepsie, dépression, paraplégies, tétraplégies, etc.
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