Ingénieur de recherche en bioinformatique (h/f)

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Ingénieur de Recherche en Bioinformatique (H/F)

Date Limite Candidature : mardi 4 mars 2025 23:59:00 heure de Paris

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Informations générales

Intitulé de l'offre : Ingénieur de Recherche en Bioinformatique (H/F)
Référence : UMR5239-CHRCHA-001
Nombre de Postes : 1
Lieu de travail : LYON 07
Date de publication : mardi 11 février 2025
Type de contrat : IT en contrat CDD
Durée du contrat : 12 mois
Date d'embauche prévue : 1 avril 2025
Quotité de travail : Complet
Rémunération : Entre 2875€ et 3550€ brut mensuel selon expérience
Niveau d'études souhaité : BAC+5
Expérience souhaitée : 1 à 4 années
BAP : A - Sciences du vivant, de la terre et de l'environnement
Emploi type : Ingénieur-e biologiste en analyse de données


Missions

La mission consiste en :

1. l’analyse de données de type « omics » (Hi-C, ChIP-Seq, MNase-Seq, etc),
2. développer des approches de biologie synthétique basées sur de l’IA,
3. assister les membres de l’équipe pour la réalisation de leurs propres analyses.


Activités

1. Analyse et visualisation de données « omics »
2. Développement d’un pipeline LLM pour la génération de séquences d’ADN artificielles
3. Développement de pipelines bioinformatiques pour les besoins spécifiques de l’équipe
4. Responsable de la gestion et sauvegarde des données brutes générées au laboratoire.


Compétences

Savoir-faire :

1. Expertise en programmation, notamment à usage des biologistes (Python et/ou R)
2. Expertise dans l’analyse de données biologiques de type « omics »
3. Expertise dans le développement bioinformatique (packages)

Savoir-être :
1. Capacité à travailler en équipe et répondre aux besoins de ses collègues
2. Capacité à gérer plusieurs projets distincts en parallèle

Transverses :
1. Capacité à se former sur de nouvelles technologies/langages
2. Veille technologique dans son domaine d’expertise


Contexte de travail

Le Laboratoire de Biologie et de Modélisation de la Cellule est un centre de recherche innovant et interdisciplinaire, dédié à l’étude des bases moléculaires régissant l’organisation et le fonctionnement des processus cellulaires dans des contextes normaux et pathologiques. À l’avant-garde des sciences biologiques, il combine expertise en biologie expérimentale et modélisation computationnelle pour déchiffrer les mécanismes fondamentaux de la vie.

L’équipe « mécanique du génome » s’intéresse au processus de réparation des cassures de l’ADN par recombinaison homologue, et son intersection avec l’organisation spatiale de la chromatine dans le noyau. Ils mobilisent des approches de génomique à haut-débit dans l’organisme modèle S. cerevisiae.

• 44 jours de congés / RTT par an
• D'excellentes conditions de travail
• Un contrat de 12 mois
• Le remboursement partiel des titres de transport (75%) + forfait mobilité durable pouvant aller jusqu'à 300€/an
• Participation financière au frais de mutuelle

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