Ingénieur.e statisticien.ne (h/f)

Job details
Job Type
Full-time
Temporary
Contract




Full Job Description

Date Limite Candidature : mercredi 18 août 2021
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Informations générales
Référence : UMR5558-LAUJAC-004
Lieu de travail : VILLEURBANNE
Date de publication : mercredi 28 juillet 2021
Type de contrat : CDD Technique/Administratif
Durée du contrat : 12 mois
Date d'embauche prévue : 1 octobre 2021
Quotité de travail : Temps complet
Rémunération : entre 2109 € et 2375 € bruts mensuels selon expérience
Niveau d'études souhaité : Bac+3
Expérience souhaitée : Indifférent


Missions
Dans la continuité de travaux précédents menés au sein du laboratoire de Biométrie et Biologie Evolutive (LBBE), l'ingénieur.e s'attachera à améliorer un simulateur d'évolution moléculaire. Cette amélioration se fera par la relaxation d'hypothèses existantes dans les simulateurs actuels, et par leur évaluation via un réseau neuronal.

Ce travail s'inscrira dans le cadre du projet ANR PIECES (ANR-20-CE45-0017)
Activités- Développement d'un simulateur d'évolution moléculaire, à partir
d'une version existante en OCaml.
- Amélioration d'un réseau neuronal convolutif prédisant une propriété
à partir d'une famille de gènes. Cette partie implique notamment une
réflexion sur la conception de ce réseau, et son implémentation.
- Veille bibliographique sur le thème de l'apprentissage automatique
pour l'évolution moléculaire.Compétences- Compétence en algèbre, statistique, algorithmique (maîtrise)
- Programmation en python et OCaml (maîtrise)
- Notions d'évolution moléculaire
- Langue anglaise B1 à B2
Contexte de travailLe projet aura lieu dans les locaux du LBBE, sur le campus de
l'université Claude Bernard Lyon I à Villeurbanne.

Le laboratoire « Biométrie et Biologie Evolutive » (LBBE) UMR 5558 du CNRS,
de l'université Claude Bernard Lyon I et de VetAgroSup compte environ
200 personnes et s'organise autour de deux thèmes fédérateurs la «
Biométrie » et la « Biologie évolutive ». Cette spécificité a présidé
à la création du laboratoire et lui confère son originalité. De plus
le LBBE présentant à la fois une composante science et santé est
réparti sur plusieurs sites à Lyon.

Les thématiques de recherche du LBBE s'organisent autour
- d'un point de vue méthodologique, qui affirme l'importance de la modélisation tant mathématique qu'informatique
- et d'une perspective évolutive qui organise les recherches indépendamment du niveau d'organisation biologique.

C'est dans la synergie entre des problématiques biologiques propres et
des développements méthodologiques que naît la plus grande part des
résultats scientifiques du laboratoire.

Le projet se déroulera au sein des équipes Baobab et Le Cocon, spécialisées respectivement dans l'algorithmique pour la bioinformatique et en évolution moléculaire. Il sera co-encadré par Laurent Jacob, chercheur en statistique et apprentissage automatique pour la biologie, et Bastien Boussau, chercheur en évolution moléculaire.