Ingénieur-e de recherche en biologie moléculaire et virologie végétale

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Présentation INRAE

L’Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement (INRAE) est un établissement public de recherche rassemblant une communauté de travail de 12 000 personnes, avec 272 unités de recherche, de service et expérimentales, implantées dans 18 centres sur toute la France. INRAE se positionne parmi les tout premiers leaders mondiaux en sciences agricoles et alimentaires, en sciences du végétal et de l’animal. Ses recherches visent à construire des solutions pour des agricultures multi-performantes, une alimentation de qualité et une gestion durable des ressources et des écosystèmes.

Environnement de travail, missions et activités

Vous exercerez votre activité au sein de l’unité UMR 1332 Biologie du Fruit et Pathologie (BFP). L’UMR 1332 BFP, acteur majeur de la recherche en biologie végétale dans la région Nouvelle-Aquitaine, est un partenariat entre les départements Biologie et Amélioration des Plantes (BAP) et Santé des Plantes et Environnement (SPE) d’INRAE et le département Sciences de l’Environnement de l'Université de Bordeaux. Forte de ses plus de 160 membres, BFP est pluridisciplinaire avec ses compétences en chimie, biochimie, biologie moléculaire, génétique, génomique, biologie synthétique, métabolomique, physiologie, microbiologie, biologie des systèmes, bioinformatique et modélisation. Au sein du BFP, vous rejoindrez l’équipe de Virologie Végétale (Viro). Cette équipe multidisciplinaire rassemble des compétences en virologie végétale, génétique, biologie moléculaire et cellulaire, biochimie, métabolomique, métagénomique et bioinformatique. Dans une approche translationnelle, elle cherche à comprendre la diversité de ces agents pathogènes, les interactions entre ces agents et leurs hôtes végétaux et les bases génétiques de la réponse des plantes à ces agents pour répondre aux enjeux de la transition agro-écologique.

Votre mission consistera à contribuer au projet EXPLORAE – PATHPHLO en étudiant les mécanismes moléculaires de la pathogénèse restreinte au phloème causée par le Barley Yellow Dwarf Virus (BYDV). Vous développerez et appliquerez des approches avancées en biologie moléculaire, protéomique et imagerie afin d’identifier les interactions virus-hôte au sein des tissus phloémiques chez les céréales.

Vous serez plus particulièrement en charge de :
- Réaliser des observations en microscopie électronique, en microscopie confocale et autres techniques d’imagerie afin d’analyser les interactions virus-hôte et les modifications ultrastructurales du phloème lors de l’infection par le BYDV.
- Mettre en œuvre des techniques de proximity labeling (TurboID), de purification de protéines et de validation des interactions protéines-protéines via co-immunoprécipitation (Co-IP) et bimolecular fluorescence complementation (BiFC).
- Isoler et transformer des protoplastes de blé afin d’étudier l’impact de l’édition ou de la répression génique de gènes candidats sur l’infection par le BYDV.

Formations et compétences recherchées

Master/Ingénieur (Bac+5)

Formation recommandée : Master 2 ou Doctorat en Biologie Moléculaire, Virologie Végétale, Biotechnologie ou Sciences Végétales. Une expérience avérée en microscopie corrélative, électronique et confocale est essentielle. De solides compétences en rédaction scientifique sont requises pour produire des rapports de recherche de haute qualité et contribuer à des propositions de projets innovants. Une expertise en planification et exécution de protocoles de biologie moléculaire et de biochimie végétale est fortement appréciée.

Connaissances souhaitées :
- Microscopie électronique et microscopie corrélative sur tissus végétaux
- Analyse des interactions protéines-protéines (CoIP, BiFC, Y2H)
- Techniques de proximity labeling (TurboID ou similaires)
- Mouvement des virus dans le système vasculaire des plantes

Expérience appréciée :
- Expérience en transformation des céréales ou manipulation de protoplastes
- Expérience préalable sur le tissu phloémien
- Connaissances en protéomique et en analyses par spectrométrie de masse

Aptitudes recherchées :
- Rigueur et attention aux détails
- Capacité à travailler en autonomie et en équipe
- Solides compétences en organisation et en gestion des données expérimentales
- Bonne capacité de communication, écrite et orale

Maîtrise de l’anglais scientifique

Votre qualité de vie à INRAE

En rejoignant INRAE, vous bénéficiez (selon le type de contrat et sa durée) :
- jusqu'à 30 jours de congés + 15 RTT par an (pour un temps plein)
- d'un soutien à la parentalité : CESU garde d'enfants, prestations pour les loisirs ;
- de dispositifs de développement des compétences : formation, conseil en orientation professionnelle ;
- d'un accompagnement social : conseil et écoute, aides et prêts sociaux ;
- de prestations vacances et loisirs : chèque-vacances, hébergements à tarif préférentiel ;
- d'activités sportives et culturelles ;
- d'une restauration collective.

Modalités pour postuler

Merci de transmettre une lettre de motivation et un CV.

Par e-mail : syed.zaidi@inrae.fr

ou

Par courrier : Syed Shan ZAIDI

UMR 1332 BFP, Viro

71 avenue Edouard Bourlaux, CS 20032

33882 Villenave d’Ornon Cedex

France

Les personnes accueillies à INRAE, établissement public de recherche, sont soumises aux dispositions du Code de la fonction publique notamment en ce qui concerne l’obligation de neutralité et le respect du principe de laïcité. A ce titre, dans l’exercice de leurs fonctions, qu’elles soient ou non au contact du public, elles ne doivent pas manifester leurs convictions, par leur comportement ou leur tenue, qu’elles soient religieuses, philosophiques ou politiques. > En savoir plus : site fonction publique.gouv.fr