Description de l'offre
Contexte du projet :
Vous serez recruté dans le cadre du projet AGENOMICS, lauréat de l'appel à projet des mutuelles AXA sur leur axe "Grand Âge".
Ce projet a pour but l'exploration des génomes d'une cohorte exceptionnelle de 1000 centenaires (Cohorte CHRONOS du CEPH) afin d'y comprendre les mécanismes moléculaires du vieillissement "en santé" de nos aînés.
Vous serez impliqué dans une étude préliminaire (projet RNAEDIT) qui a pour but d'explorer des données de WGS et RNA-seq afin de détecter des bases éditées sur l'ARN. Ce mécanisme d'édition médié par les protéines de type APOBEC et ADAR permet d'apporter encore plus de diversité génétique aux transcrits – que les classiquement étudiés variants.
Cette étude préliminaire se fera sur des échantillons de sang et de cerveau d'individus centenaires non déments que l'on comparera à des individus non centenaires Alzheimer.
Missions :
Votre mission sera de mettre en place le pipeline informatique d'étude de l'édition reposant sur ce qui est fait dans la littérature afin de détecter des sites édités sur l'ARN fiables et d'éviter les faux-positifs.
Il y aura donc plusieurs phases de travail : bibliographie, développement et test du pipeline, traitement des données, analyse et critique des résultats et rédaction d'un article.
Le CEA est un acteur engagé dans l’accueil l’insertion et le maintien dans l’emploi des salariés en situation de handicap.
Si vous êtes intéressé,
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