Poste Titulaire Ingénieur de Recherche Analyse d’Image (Université de Strasbourg, affectation IGBMC)
Pour répondre à des besoins multidisciplinaires, la plateforme de microscopie photonique de l’IGBMC (CNRS UMR 7104 – Inserm U 1258) dispose de 15 systèmes optiques (microscopes champ large, confocaux, multiphoton, spinning disk, microscope à feuille de lumière, macroscopes, microdissecteur laser, techniques de type FRET, FRAP). La plateforme de microscopie est aussi équipée de stations de travail pour le traitement et l’analyse des données et a accès au cluster HPC de l’Institut. Dans ce contexte, l’Ingénieur de Recherche aura pour mission de créer et développer un service de gestion de données, de traitement et d’analyse d’images biologiques au sein de la plateforme de microscopie photonique. L’ingénieur(e) interagira avec les membres du Centre d’Imagerie (microscopie photonique et électronique, criblage haut-débit) et avec les utilisateurs du service (équipe IGBMC et utilisateurs extérieurs) et assurera la formation et le support aux utilisateurs.
Activités principales:
* Développer une infrastructure pour l’analyse des bioimages (plugins ImageJ, logiciels, station d’analyse, serveur).
* Assister les équipes de recherche dans la conception et la mise au point de stratégies d’analyse, de traitement et de stockage d’images.
* Créer et déployer des outils d’analyse personnalisés pour les projets scientifiques de l’institut.
* Développer des applications originales et innovantes (intelligence artificielle i.e. deep learning, machine learning, plugins ImageJ).
* Conseiller les utilisateurs et les partenaires sur les possibilités et limites des techniques disponibles, sur l’interprétation des données.
* Contribuer au développement des solutions de gestion, le stockage et le transfert sur le réseau de grands volumes de données multiparamétriques en lien avec le service informatique de l’IGBMC (data management, big data, serveur OMERO).
#J-18808-Ljbffr
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