Depuis 2017, l'Institut de Convergence INCEPTION vise à développer des solutions innovantes au défi mondial de l'émergence des maladies en créant des synergies entre différents domaines d'expertise (biologie, médecine, informatique, mathématiques, statistiques, physique et sciences sociales). Ce projet fédère 10 partenaires académiques et plus de 80 équipes autour de 4 axes thématiques couvrant le développement de méthodes pour la biologie intégrative, l'étude de l'émergence des maladies dans les populations et les individus, et le dialogue entre la biologie et les sciences sociales. À la suite du constat de la connaissance partielle par les chercheurs des bases de données humaines existantes d'une part et du nombre croissant et de l'éparpillement des bases de données générées par les projets INCEPTION d'autre part, l'Institut Pasteur souhaite cartographier et caractériser ces bases de données.
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Missions/Activités
Votre mission consistera à cartographier et caractériser les bases de données utilisées et générées par les équipes d'INCEPTION (chez l'humain). L'objectif étant d'avoir une meilleure visibilité sur les sources de données pouvant avoir un intérêt pour INCEPTION et pour la communauté scientifique.
Votre mission concernera les actions suivantes :
- Définir les critères de caractérisation des bases de données : nature des données, quantification/volumétrie, type de base de données, mode de partage des données, conditions de réutilisation, point de contact, contraintes réglementaires et éthiques, démarches à effectuer pour réutiliser les données
- Réaliser des entretiens avec les porteurs de projet INCEPTION pour recueillir les informations souhaitées,
- Analyser les publications et les plans de gestion des données pour identifier les bases de données citées,
- Analyser les caractéristiques des bases de données identifiées,
- Synthétiser les résultats sous forme de tableau, cette cartographie constituant le livrable principal du projet,
- Rédiger une synthèse sur les démarches à effectuer pour réutiliser les données provenant de ces bases de données.
Sur la base de cette cartographie, vous pourrez également être amené à formuler des recommandations sur les meilleures pratiques de partage de données humaines ainsi que sur les bases et entrepôts de données à prioriser pour le partage de données.
Pour cette mission, vous serez rattaché au Centre de Ressources en Information Scientifique (CeRIS) et vous collaborerez avec la Plateforme de Data Management, la Direction juridique, le Pôle de coordination de la recherche clinique.
Vous serez amené à être un·e interlocuteur·ice régulier·ère des équipes INCEPTION concernées par le projet de cartographie.
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