Ingénieur de recherche f/h pour la gestion de données participative sur les plantes

Contexte et atouts du poste

Le projet "FLOWERS" financé par l'Agence Nationale pour la Recherche réunit des chercheurs en informatique, biologie évolutive, botanique, écologie, à Rennes, Montpellier, Lyon, et Sydney.

Son objectif est de comprendre le succès évolutif des plantes à fleur à partir de l'évolution de traits morphologiques, fonctionnels, écologiques. Les données morphologiques permettront en plus de construire des clefs d'identification des plantes, et les relier à leurs usages ethnobotaniques ou agro-écologiques.

Dans ce cadre nous recrutons un.e ingénieur.e à Lyon pour mettre en place une plateforme pour la gestion participative des données.

Le poste est financé par l'Inria Lyon, partenaire du projet FLOWERS, et est basé au laboratoire de biométrie et biologie évolutive, sous la responsabilité de Eric Tannier et Philippe Veber. Le laboratoire est largement multidisciplinaire (génomique, écologie, santé).

Il y aura des occasions de déplacement à Rennes ou Montpellier pour rencontrer les personnes impliquées.

Mission confiée

Nous maintenons une base de données collaborative sur les plantes à fleurs (traits morphologiques, fonctionnels, écologiques, ethnobotaniques) qui vont être utilisés à plusieurs fins : - l'identification des plantes sur des petits espaces géographiques avec un outil communautaire- l'étude de l'évolution de traits reproductifs et leur association avec les taux de diversification Nous avons besoin de développer - un schéma de description des données évolutif qui permette de progressivement remplir les deux types de besoins.- un outil numérique qui permette la saisie participative des données par des utilisat·eurs·rices authentifiées.- des protocoles d'import - export des données pour permettre l'interopérabilité avec des sources externes. Afin de mettre ces éléments au point nous recrutons un.e ingénieur.e d'étude spécialisé.e en développement web et manipulation de données, motivé.e par l'évolution et les plantes, connaissant si possible OCaml.

Principales activités

Principales activés (5 maximum) :

1. Analyser les besoins des partenaires
2. Proposer des solutions pour la gestion participative des données
3. Développer une plateforme implémentant cette solution
4. Rédiger la documentation
5. Tester, modifier, valider
6. Animer une communauté d’utilisateurs

Compétences

Les savoir-faire utiles pour le projet sont :

7. programmation web côtés client et serveur, notamment une expérience avec les bibliothèques de visualisation de données ou d'interfaces utilisateurs telles que Vuejs, React ou d3js
8. parsing / unparsing de données dans les formats d'échange standards (JSON par exemple), développement d'analyseurs syntaxiques dédiés
9. des notions de programmation fonctionnelle (utilisation préalable d'un langage fonctionnel fortement typé comme OCaml, Rust, Scala, F# ou Haskell)
10. bonnes connaissance des techniques et outils de génie logiciel (suivi de version, documentation, test unitaire, intégration continue, forges logicielles)

Il n'est bien entendu pas nécessaire de maîtriser tous ces aspects pour candidater

D'autre part il est préférable d'avoir un intérêt pour les plantes et la botanique, et une volonté d'apprendre à reconnaître les plantes, même si aucun prérequis n'est exigé.

Avantages

11. Restauration subventionnée
12. Transports publics remboursés partiellement
13. Congés : 7 semaines de congés annuels + 10 jours de RTT (base temps plein) + possibilité d'autorisations d'absence exceptionnelle (ex : enfants malades, déménagement)
14. Possibilité de télétravail (90 jours par an flottants) et aménagement du temps de travail (sauf pour les stagiaires et apprentis)
15. Prestations sociales, culturelles et sportives (Association de gestion des œuvres sociales d'Inria)
16. Accès à la formation professionnelle
17. Participation employeur mutuelle santé (sous conditions)

Rémunération

A partir de 2 692 € brut mensuel selon expérience et diplômes.