Concevoir et organiser le traitement de données issues de l'imagerie calcique du cerveau entier de la larve du poisson zèbre, en utilisant un microscope à feuille de lumière bi-photonique. Analyse des données en utilisant en de data mining, machine learning et IA.
Activités
- Traiter les données obtenues avec des méthodes mathématiques complexes.
- Concevoir les modèles mathématiques adaptées
- Diffuser et valoriser les résultats et réalisations technologiques sous forme de publications, et présentations aux congrès.
Compétences
Expérience en biologie computationnelle. Bsc en informatique. Le candidat/la candidate doit pouvoir analyser des données d'une grande dimensionnalité (big data) en utilisant des méthodes de réduction de dimensionnalité (PCA, factor analysis, ICA, etc), et formuler des modèles mathématiques adaptés. Connaissances en optique seront un plus.
Contexte de travail
L'Institut de biologie de l'ENS (IBENS) est un centre de recherche fondamentale qui mène des recherches originales visant à décrypter les mécanismes fondamentaux au coeur des processus biologiques.
Unité mixte ENS-CNRS-INSERM, l'IBENS accueille plus de 300 personnes regroupées en 30 équipes autonomes conduisant une recherche hautement collaborative et multidisciplinaire qui allie approches expérimentales et théoriques.
L'activité de recherche couvre des champs thématiques variés : Neurosciences, Biologie du développement, Génomique fonctionnelle, Écologie et biologie de l'évolution.
Plusieurs plateformes technologiques, notamment en imagerie, génomique, protéomique et bio-informatique sont à la disposition des chercheurs. Les recherches menées à l'IBENS bénéficient des interactions avec d'autres disciplines présentes à l'ENS (physique, chimie, sciences cognitives, mathématiques). L'IBENS est activement impliqué dans la formation des étudiants et jeunes chercheurs à tous les niveaux.
L'objectif de l'équipe est de comprendre les processus computationnels des circuits neuronaux et leur lien avec le comportement.
Le candidat/la candidate travaillera en étroite collaboration avec German SUMBRE et des autres membres de l'équipe.
Contraintes et risques
travail sur ordinateur
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