Le candidat caractérisera l'interaction de protéines liant la pénicilline (PLPs) du pneumocoque avec des fragments de peptidoglycane. Le pneumocoque est un important pathogène humain qui résiste à la pénicilline par l'expression de transpeptidase du peptidoglycane (PLPs) d'affinité réduite. Ces enzymes conservent leur activité transpeptidase sans réagir avec la pénicilline. L'interaction des PLPs avec la pénicilline est bien connue, l'interaction avec le peptidoglycane reste inconnue.
Activités
- Produire et purifier des protéines (PLPs recombinantes)
- Cribler des conditions de cristallogenèse
- Développer des méthodes de mesure d'interaction moléculaire adaptées au peptidoglycane
- Mesurer des interactions protéines/ligands (cinétique, affinité)
- Mesurer des activités antibiotiques contre différentes souches de pneumocoque
- Tenir un cahier de laboratoire et archiver les données et ressources
- Présenter les résultats en réunions de laboratoire
- Participer à la rédaction de publications
- Appliquer et faire appliquer les règles d'hygiène et de sécurité du domaine
Compétences
- Biochimie (purification de protéines)
- Interactions moléculaires in vitro
- Enzymologie
- Microbiologie (culture bactérienne)
- Anglais (écrit/oral) niveau B1 de cadre européen de référence pour les langues (CECRL)
- Sens de l'organisation, rigueur et fiabilité
- Sans relationnel, esprit d'équipe
- Aisance dans la communication écrite et orale
Contexte de travail
Situé sur le Polygone scientifique de Grenoble (ESRF/ILL/EMBL/IBS), l'Institut de Biologie Structurale (IBS) est un acteur d'envergure nationale et internationale dans le domaine de la biologie structurale intégrée. A la fois centre de recherche, plateau technique, site d'accueil et de formation scientifique, l'IBS a pour vocation le développement de recherches en biologie structurale, un champ de recherche capital pour la compréhension des mécanismes biologiques fondamentaux. Il s'appuie sur 12 plateformes à la pointe de la technologie.
En tant qu'unité mixte de recherche (CEA-CNRS-UGA) l'IBS est composé de 20 groupes de recherche, chacun de ces groupes proposant une approche multi-disciplinaire, aux frontières de la biologie, de la physique et de la chimie, en cohérence avec 3 axes de recherche. Près de 320 personnes y travaillent chercheurs, doctorants, ingénieurs et techniciens dans un environnement multiculturel et international.
La personne recrutée intégrera le Groupe Pneumocoque qui travaille sur la paroi bactérienne chez le pneumocoque (https://www.ibs.fr/en/research/microbiology-infection-and-immunity/pneumococcus-group-c-morlot/).
Contraintes et risques
Sans.
L'activité se fera indifféremment en français ou anglais, néanmoins il est attendu que le candidat non-francophone s'efforce d'apprendre les bases du français afin de faciliter la communication et son intégration dans le laboratoire.
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