CLINATEC travaille sur un grand projet d’Interface Cerveau-Machine (BCI) qui a pour objectif de développer et réaliser la validation clinique de la technologie WIMAGINE [1] de mesure et de décodage de l’activité cérébrale. Cette technologie est utilisée aujourd’hui dans le cadre de plusieurs essais cliniques, pour faire la preuve qu’un sujet tétraplégique peut piloter un exosquelette à partir de son activité cérébrale [2] ou pour permettre la restauration de la marche chez un patient paraplégique grâce à une Interface Cerveau Moelle épinière [3].
Pour soutenir son développement, Clinatec propose un stage M2 Ingénieur(e) développement logiciel (C++/Python/Qt).
[1] C. Mestais, G. Charvet, F. Sauter-Starace, M. Foerster, D. Ratel, and AL. Benabid, “WIMAGINE: Wireless 64-Channel ECoG Recording Implant for Long Term Clinical Applications”, IEEE Trans Neural Syst Rehabil Eng. 2015 Jan;23(1):10-21
[2] Benabid, Alim Louis, et al. "An exoskeleton controlled by an epidural wireless brain–machine interface in a tetraplegic patient: a proof-of-concept demonstration." The Lancet Neurology 18.12 (2019): 1112-1122.
[3] Lorach et al., “Walking naturally after spinal cord injury using a brain-spine interface” Nature. 2023 Jun; 618(7963):126-133.doi: 10.1038/s41586-023-06094-5.
Les codes de traitement de données BCI/BSI ont été développés en MATLAB par plusieurs générations de doctorants/post-docs. Ils sont composés de trois codes en parallèle :
• Le code du logiciel de décodage en temps réel ABSD
• Une librairie de fonctions extraites d’ABSD appelée BCItools, servant de base aux développements de scripts de test (offline ou pseudo-online) pour les membres de l’équipe traitement du signal.
• Un code « light » de décodeur temps réel, capable de tourner sur une plateforme embarquée, et développé en C++ par les équipes du LIST dans le cadre du projet NEMO-BMI.
Ces trois codes ont vécu en parallèle, subissant des modifications parfois indépendantes. Toute modification commune nécessite la mise à jour des trois codes.
Le but de ce stage est de ré-implémenter les fonctions clés du décodage BCI sous forme d’une librairie Python/C++ unique.
Elle servira de base au développement de scripts de simulation d’entraînement et de décodage pour les tests offlines, ainsi que de fonctions élémentaires pour le redéveloppement du logiciel de décodage en temps-réel.
A terme, cela permettra de faciliter et d’accélérer les développements futurs, grâce à une centralisation des codes de base. Cela permettra aussi de s’affranchir de MATLAB et de ses problèmes de licences, tout en donnant accès aux librairies Python, devenues maintenant le standard du machine Learning.
Ce stage s'adresse à un élève ingénieur (H/F) en dernière année de formation en développement logiciel.
Il est nécessaire de maitriser Python, C++, et MATLAB.
Des bases en traitement du signal et machine Learning sont souhaitées.
Le.la stagiaire évoluera au sein d’une équipe pluridisciplinaire dans le cadre du centre de recherche biomédicale CLINATEC®. Des qualités de travail en équipe sont requises.
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